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特應(yīng)性皮炎與銀屑病之間差異表達的微小RNA及其生物學功能

發(fā)布時間:2024-12-11 21:43
   目的探討特應(yīng)性皮炎(AD)與銀屑病之間差異表達的微小RNA(miRNA)及其生物學功能。方法采用第二代測序技術(shù)對8例AD及8例銀屑病皮損組織的miRNA表達譜進行高通量測序,篩選差異表達的miRNA。使用實時熒光定量PCR技術(shù),選取上、下調(diào)表達差異顯著的miRNA進行高通量測序結(jié)果的驗證。針對差異表達miRNA進行靶基因預測,取交集后進行基因本體功能及京都基因和基因組百科全書通路富集分析。結(jié)果 AD與銀屑病相比,有204個差異表達的miRNA,包括168個表達上調(diào)的miRNA和36個表達下調(diào)的miRNA。上調(diào)基因hsa-miRNA-133a-3p和下調(diào)基因hsa-miRNA-199b-3p的驗證結(jié)果與檢測結(jié)果具有較好的一致性。差異表達miRNA的靶基因多富集在蛋白結(jié)合、離子結(jié)合、生物調(diào)節(jié)、細胞代謝等分子功能和生物功能上,多涉及代謝途徑、磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信號通路、EB病毒感染及絲裂原活化蛋白激酶信號通路等。結(jié)論 AD與銀屑病之間存在多個差異表達的miRNA,其涉及多種生物功能及通路;PI3K/Akt通路、脂質(zhì)代謝途徑等通路在AD和銀屑病的發(fā)生及病情演變...

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 資料和方法
    1.1 高通量測序標本來源
    1.2 試劑與儀器
    1.3 高通量測序方法
        1.3.1 標本獲取:
        1.3.2 總RNA提取:
        1.3.3 文庫的構(gòu)建與測序:
        1.3.4 測序數(shù)據(jù)分析和處理:
    1.4 實時熒光定量PCR驗證
        1.4.1 標本來源:
        1.4.2 引物設(shè)計:
        1.4.3 實時熒光定量PCR檢測:
    1.5 生物信息學分析
    1.6 統(tǒng)計學分析
2 結(jié) 果
    2.1 差異表達miRNA的篩查結(jié)果
    2.2 實時熒光定量PCR驗證結(jié)果
    2.3 生物學分析結(jié)果
3 討 論



本文編號:4016323

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