發(fā)布時(shí)間：2020-10-31 06:19

　　 目的:本研究旨在從HMGB1基因范圍內(nèi)篩選出與HBV感染所致急性肝衰竭密切關(guān)聯(lián)的標(biāo)簽SNP位點(diǎn)和單倍型,進(jìn)行關(guān)聯(lián)研究分析,由此可能提供一種新的立足于基因的預(yù)測(cè)方法,可以對(duì)HBV感染所致急性肝衰竭易患性進(jìn)行早期預(yù)測(cè),為臨床醫(yī)生提供預(yù)警信息。方法:通對(duì)HMGB1基因進(jìn)行系統(tǒng)掃描并查詢大量國(guó)內(nèi)外相關(guān)文獻(xiàn),確定7個(gè)SNP位點(diǎn),由1000Genomes數(shù)據(jù)庫(kù)下載中國(guó)北京漢族人群的SNP基因分型數(shù)據(jù),利用Haploview軟件進(jìn)行連鎖不平衡分析,構(gòu)建該基因的單倍型并進(jìn)行標(biāo)簽SNPs的篩選。選擇2012年9月至2018年12月我院住院或門診診治的急性肝衰竭患者64例,男33例,女31例,平均年齡(39.14±8.28),樣本符合本課題納入標(biāo)準(zhǔn),收集樣本需獲得受試者的知情同意。以數(shù)據(jù)庫(kù)源信息作為對(duì)照組,采用一代測(cè)序法對(duì)疾病組的SNPs進(jìn)行基因分型,SPSS19.0軟件分析標(biāo)簽SNPs的基因型、等位基因及單倍型在兩組中的分布差異。結(jié)果:通過查找發(fā)現(xiàn)HMGB1基因在人類第13號(hào)染色體上,所獲取的HMGB1基因序列范圍內(nèi)共構(gòu)建5種常見單倍型(C-C、T-G、G-T-A-A、G-C-G-C、C-C-G-C)和3個(gè)標(biāo)簽SNPs(rs1045411、rs2249825、rs1412125),其中rs2249825和rs1412125的基因型、等位基因頻率在疾病組與對(duì)照組分布存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05),由rs2249825、rs1412125、rs9508752、rs2892547位點(diǎn)構(gòu)建的單倍型G-C-G-C、C-C-G-C頻率在中兩組分布有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05)。結(jié)論:HMGB1基因多態(tài)性與HBV感染致急性肝衰竭顯著相關(guān),其中所構(gòu)建的單倍型包括G-C-G-C、C-C-G-C(rs2249825-rs1412125-rs9508752-rs2892547),挑選的標(biāo)簽SNPs包括rs2249825、rs1412125。以上單倍型均可能增加患HBV感染致急性肝衰竭的風(fēng)險(xiǎn),且挑選的標(biāo)簽SNPs攜帶C等位基因的人群也可能增加HBV感染致急性肝衰竭的易感性。
【學(xué)位單位】：山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類】：R575.3
【部分圖文】：

山西醫(yī)科大學(xué)（博）碩士學(xué)位論文2 結(jié) 果從 1000Genomes 數(shù)據(jù)庫(kù)查得 HMGB1 基因在人類第 13 號(hào)染色體上，獲取中北京漢族人群（CHB）的 7 個(gè) SNP 位點(diǎn)基因分型數(shù)據(jù)，其中 MAF 有 6 個(gè)＞0.05rs1360485 未在該人群中找到。所獲取的 HMGB1 基因序列范圍內(nèi)共 2 個(gè)單倍域Block1 全長(zhǎng) 3kb，有 2 個(gè) SNP 位點(diǎn)（rs1045411 和 rs3742305），構(gòu)成 2 種常見倍型（C-C 和 T-G），第 1 位點(diǎn)是標(biāo)簽 SNPs（即 rs1045411）；Block2 全長(zhǎng) 5k有 4 個(gè) SNP 位點(diǎn)（rs2249825、rs1412125、rs9508752 和 rs2892547），構(gòu)成 3常見單倍型（G-T-A-A、C-C-G-C 和 G-C-G-C），第 3、4 位點(diǎn)是標(biāo)簽 SNPs（即 rs2249和 rs1412125）。疾病組的 rs1360485 因 MAF＜0.05 也被排除（見圖 2-1、2-2）

山西醫(yī)科大學(xué)（博）碩士學(xué)位論文2 結(jié) 果從 1000Genomes 數(shù)據(jù)庫(kù)查得 HMGB1 基因在人類第 13 號(hào)染色體上，獲取中北京漢族人群（CHB）的 7 個(gè) SNP 位點(diǎn)基因分型數(shù)據(jù)，其中 MAF 有 6 個(gè)＞0.05rs1360485 未在該人群中找到。所獲取的 HMGB1 基因序列范圍內(nèi)共 2 個(gè)單倍域Block1 全長(zhǎng) 3kb，有 2 個(gè) SNP 位點(diǎn)（rs1045411 和 rs3742305），構(gòu)成 2 種常見倍型（C-C 和 T-G），第 1 位點(diǎn)是標(biāo)簽 SNPs（即 rs1045411）；Block2 全長(zhǎng) 5k有 4 個(gè) SNP 位點(diǎn)（rs2249825、rs1412125、rs9508752 和 rs2892547），構(gòu)成 3常見單倍型（G-T-A-A、C-C-G-C 和 G-C-G-C），第 3、4 位點(diǎn)是標(biāo)簽 SNPs（即 rs2249和 rs1412125）。疾病組的 rs1360485 因 MAF＜0.05 也被排除（見圖 2-1、2-2）
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本文編號(hào)：2863563