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2型糖尿病胰島功能衰竭的多組學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-11-14 00:22
   胰島β細(xì)胞數(shù)量減少和功能缺失是T2D(type 2 diabetes,2型糖尿病)發(fā)生的重要因素,其機(jī)制非常復(fù)雜,受到大量分子動(dòng)態(tài)調(diào)控。目前已報(bào)道有多種事件與該過(guò)程相關(guān),如內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激(endoplasmic reticulum stress)、氧化應(yīng)激(oxidative stress)、炎癥通路激活及AS(alternative splicing,可變剪切)等,但缺乏系統(tǒng)層面的分析。為了研究胰島衰竭的分子變化過(guò)程,我們選擇了與人類T2D表型非常相似的GK(Goto-Kakizaki)大鼠動(dòng)物模型作為研究對(duì)象。利用RNA-Seq和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),我們對(duì)4到24周不同周齡GK大鼠的胰島組織進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組定量分析。研究發(fā)現(xiàn)GK大鼠的胰島衰竭過(guò)程呈現(xiàn)出兩個(gè)不同的階段特征:在早期階段(4到6周)胰島細(xì)胞主要代謝類型由有氧氧化磷酸化逐漸轉(zhuǎn)向無(wú)氧糖酵解,并伴隨低水平炎癥反應(yīng)及胰島素合成代償性增加;而隨著疾病發(fā)展,在后期階段(8到24周)胰島組織炎癥反應(yīng)急劇增強(qiáng),同時(shí)β細(xì)胞功能性代償機(jī)制喪失。通過(guò)對(duì)基因表達(dá)水平進(jìn)行時(shí)序分析,我們共發(fā)現(xiàn)了 5551個(gè)DEGs(differential expression genes,差異表達(dá)基因),且其中大部分為首次報(bào)道與T2D相關(guān)。我們相信這些組學(xué)數(shù)據(jù)對(duì)于T2D后續(xù)研究和定量分析具有重要參考價(jià)值。此外,我們還發(fā)現(xiàn)了一個(gè)參與胰島β細(xì)胞AS調(diào)控過(guò)程的新蛋白DDX1(DEAD-boxhelicase 1)。通過(guò)RNA-Seq和CLIP-Seq聯(lián)合分析,我們鑒定出了數(shù)百DDX1直接靶向的ASGs(alternative splicing genes,可變剪切基因)。這些基因主要編碼鈣離子結(jié)合蛋白、高電壓門控鈣離子通道和跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)體,與胰島素分泌密切相關(guān)。抑制INS-1細(xì)胞中的DDX1蛋白表達(dá),可引起細(xì)胞中鈣離子濃度降低且胰島素分泌過(guò)程受損,表明DDX1在胰島β細(xì)胞AS和胰島素分泌過(guò)程中有著重要作用。
【學(xué)位單位】:華中科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R587.1
【部分圖文】:

示意圖,糖尿病,多維度,最小因子


逐漸加入了進(jìn)來(lái)[43],如何進(jìn)行多維度數(shù)據(jù)聯(lián)合分析是現(xiàn)在急需解決的難題,我們需??要定義出能解釋該疾病的最小因子集合,并對(duì)差異進(jìn)行定量描述,這也是目前及未??來(lái)T2D精準(zhǔn)醫(yī)療研究的重點(diǎn)[44]。圖1.2為Florez等最新提出的糖尿病精準(zhǔn)醫(yī)療工作??模型p2]。??CUnical-based?categortet?integrated?data?Oata-drtven?categortes??HM1c2M<9%?Ckttlmy??VI—i?蠱魚?^? ̄??I???insuln?res^tince??重里???0?wncirionnafeof)?_?Clu?ltr3??(Wnon^/transaiftoiKS)???m?MMabotocnics?pra?t?AT?Attorwbmy??KS?A???Btoodmelaboiams?W????Trssu^-^toftoty?metaboMe?Clusltr4????dynomcs?〇cel/lvei/??Oulmicrottot.??A?Ultttylt?brtwviori??|||£?HP??圖1.2精準(zhǔn)醫(yī)療在糖尿病中的應(yīng)用??示意圖表示如何通過(guò)多維度的生物大數(shù)據(jù)整合來(lái)實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療在糖尿病中的應(yīng)用,建立新的??疾病分類標(biāo)準(zhǔn),達(dá)到更佳有效的治療目的。??6??

胰腺,胰島,轉(zhuǎn)錄因子,器官形成


凋亡水平明顯較高[68]。但近期研宄結(jié)果表明,胰島P細(xì)胞數(shù)量的減少是細(xì)胞新生??(neogenesis)、增殖(proliferation)和調(diào)亡共同影響的結(jié)果[7()]。其中新生胰島P細(xì)??胞主要來(lái)自干細(xì)胞或祖細(xì)胞分化(圖1.5)?[71],或其他細(xì)胞轉(zhuǎn)化[72 ̄74],增殖來(lái)自胰島??P細(xì)胞的自我復(fù)制,而凋亡則是由細(xì)胞凋亡通路觸發(fā)的細(xì)胞程序性死亡。胰島卩細(xì)胞??新生、增殖和凋亡均受到細(xì)胞內(nèi)外大量的信號(hào)調(diào)控,它們的綜合水平?jīng)Q定了胰島P??細(xì)胞數(shù)量的多少,Erica?Manesso等利用HIP大鼠模型對(duì)這一過(guò)程進(jìn)行了數(shù)學(xué)分析,??10??

剪切體,剪切因子,順式調(diào)控元件,沉默子


華中科技大學(xué)博士學(xué)位論文??過(guò)程依賴于剪切體(spliceosome)來(lái)執(zhí)行(圖1.6)?[78]。其中剪切體由5個(gè)snRNP,??Ul、U2、U4/U6、U5以及近200個(gè)蛋白質(zhì)共同組成,Markus?C.?Wahl等對(duì)其動(dòng)態(tài)組??裝和工作過(guò)程進(jìn)行了詳細(xì)描述[79]。順式調(diào)控元件和反式剪切因子的作用關(guān)系被稱為??“剪切密碼”,其綜合作用效果決定了剪切信號(hào)是促進(jìn)還是抑制。具體順式調(diào)控元??件有?ESE(exonic?splicing?enhancer,外顯子剪切增強(qiáng)子)、ESS(exonic?splicing?silencer,??外顯子剪切沉默子)、ISE(?intronic?splicing?enhancer,內(nèi)含子剪切增強(qiáng)子)、ISS?(intronic??splicing?silencer,內(nèi)含子剪切沉默子),分別對(duì)應(yīng)外顯子或內(nèi)含子可以促進(jìn)或抑制??AS發(fā)生的區(qū)域。常見的剪切因子有SR?(serine/arginine-rich?proteins,絲氛酸/精氣??酸富集蛋白)和hnRNP?(heterogeneousnuclear?RNPs,核不均一核糖核蛋白)蛋白家??族[8()]
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本文編號(hào):2882831

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