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基于微陣列數(shù)據(jù)探討金屬硫蛋白在吸煙者氣道的變化及其可能機制

發(fā)布時間:2024-07-02 20:38
  目的探討吸煙對氣道金屬硫蛋白(MT)表達(dá)的影響及其可能機制。方法獲取公共基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(GEO)的微陣列矩陣數(shù)據(jù)并進(jìn)行整合分析,以確定煙霧暴露后MT表達(dá)的變化趨勢;同時使用mi RDB數(shù)據(jù)庫預(yù)測靶向16個MT的mi RNA,CLUSTAL W軟件對MT m RNA進(jìn)行多序列比對。結(jié)果急性吸煙刺激氣道MT表達(dá),慢性吸煙抑制氣道MT表達(dá)。慢性吸煙者氣道MT1、MT2、MT3表達(dá)與吸煙指數(shù)呈顯著負(fù)相關(guān),但其不影響MT4表達(dá)。MT1、MT2、MT3 m RNA序列包含"CTCCTGC"片段,可與hsa-mi R-4722-5p種子區(qū)域匹配,而MT4 m RNA序列缺乏結(jié)合位點。結(jié)論 MT1、MT2、MT3和hsa-mi R-4722-5p可能是減輕吸煙損傷和預(yù)防慢性阻塞性肺疾病(COPD)進(jìn)展的潛在靶點。

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
1 資料和方法
    1.1 矩陣GSE97010和GSE14383數(shù)據(jù)處理[9]
    1.2 整合分析
        1.2.1 獲取和篩選微陣列數(shù)據(jù)
        1.2.2 探針過濾和基因映射
        1.2.3 組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(ICC)
        1.2.4 統(tǒng)計分析
    1.3 建立線性回歸模型
    1.4 miRNA預(yù)測[10-11]
2 結(jié)果
    2.1 急性煙霧暴露和CSC對MT的影響
    2.2 長期煙霧暴露對氣道MT1、MT2和MT3表達(dá)的影響
    2.3 吸煙指數(shù)對氣道MT1、MT2和MT3的影響
    2.4 hsa-miR-4722-5p對長期煙霧暴露氣道MT1、MT2、MT3的影響
3 討論



本文編號:3999978

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