基于HLA等位基因頻率的全球人群親緣關(guān)系初探
本文關(guān)鍵詞: 人類白細(xì)胞抗原 等位基因頻率 免疫遺傳學(xué) 群體遺傳學(xué) 出處:《東南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2014年04期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的:探討不同實(shí)驗(yàn)方法、不同統(tǒng)計(jì)方法的HLA配型數(shù)據(jù)在分析全球人群親緣關(guān)系中的作用和效能,為運(yùn)用HLA基因的多態(tài)性分析全球人群的遺傳關(guān)系提供理論依據(jù)。方法:收集了全球6大洲10個(gè)地理分區(qū)中的110個(gè)人群HLA-A,-B和-DRB1座位的高分辨率配型數(shù)據(jù),并對(duì)這些等位基因命名進(jìn)行了歸一化處理,用統(tǒng)一的統(tǒng)計(jì)方法重新統(tǒng)計(jì)了各人群的等位基因頻率,用N-J法構(gòu)建了全球人群的關(guān)系樹,進(jìn)而對(duì)全球人群間的親緣關(guān)系進(jìn)行了初步分析。結(jié)果:同一地理區(qū)域內(nèi)的人群相互聚類,不同區(qū)域間的人群完全分離。關(guān)系樹不僅能很好地分析局部地區(qū)相似人群的異同,也能有效地分析全球各區(qū)域人群間的親緣關(guān)系。結(jié)論:HLA基因的多態(tài)性適合對(duì)全球人群的親緣關(guān)系進(jìn)行研究,也是一種高效的研究人類學(xué)的分子標(biāo)記物。
[Abstract]:Objective: to explore the role and efficacy of HLA matching data of different experimental methods and different statistical methods in the analysis of genetic relationships in global population. Methods: the high resolution matching data of HLA-An B and DRB1 loci in 110 populations from 10 geographical regions of 6 continents were collected. The allele nomenclature is normalized, the allele frequency of each population is recounted by unified statistical method, and the relationship tree of global population is constructed by N-J method. The relationship tree can not only analyze the similarities and differences of similar populations in local areas, but also cluster each other in the same geographical area. Conclusion the polymorphism of the HLA gene is suitable for the study of the genetic relationship of the global population and is also an effective molecular marker for anthropological research.
【作者單位】: "發(fā)育與疾病相關(guān)基因"教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室東南大學(xué)生命科學(xué)研究院;
【基金】:國家杰出青年基金資助項(xiàng)目(30325017)
【分類號(hào)】:R394
【相似文獻(xiàn)】
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3 曲U,
本文編號(hào):1507620
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