E3連接酶CHIP泛素化IRE1的分子機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2024-06-04 01:27
內(nèi)質(zhì)網(wǎng)是真核細(xì)胞中蛋白質(zhì)合成、折疊與分泌的重要細(xì)胞器,它的內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定是細(xì)胞維持正常功能的基本需求。在某種環(huán)境因素刺激下,合成后蛋白質(zhì)在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中發(fā)生錯(cuò)誤的折疊和修飾,導(dǎo)致其穩(wěn)態(tài)失衡,形成內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力(endoplasmic reticulum stress, ER stress)。細(xì)胞內(nèi)存在一系列信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,對(duì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力實(shí)行應(yīng)答,這些應(yīng)激通路一般稱為錯(cuò)誤折疊蛋白質(zhì)應(yīng)激(unfolded protein response, UPR)。肌醇需求蛋白質(zhì)1(inositol-requiring protein-1, IRE1)是一個(gè)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜蛋白質(zhì),是UPR中三個(gè)重要的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力感受器和信號(hào)傳導(dǎo)蛋白質(zhì)之一。盡管人們對(duì)IRE1的分子機(jī)制已有相當(dāng)程度的了解,但是有關(guān)IRE1與其他蛋白質(zhì)的相互作用、它的信號(hào)通路調(diào)控、以及翻譯后修飾的可能性等方面的知識(shí)依然匱乏。本課題以IRE1為研究對(duì)象,通過(guò)蛋白質(zhì)互作分析,發(fā)現(xiàn)IRE1相互作用的蛋白質(zhì),進(jìn)而聚焦于IRE1相關(guān)的修飾和信號(hào)通路,試圖發(fā)現(xiàn)和闡明內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力條件下IRE1的新功能和可能的分子機(jī)制。利用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法,我們?cè)贗RE1的免疫共沉淀物中發(fā)現(xiàn)了若干泛素...
【文章頁(yè)數(shù)】:108 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
專業(yè)詞匯中英文對(duì)照表
第一章 緒論
1.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的結(jié)構(gòu)和功能
1.1.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的分類與結(jié)構(gòu)
1.1.2 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的功能
1.2 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與錯(cuò)誤折疊蛋白應(yīng)激
1.2.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與錯(cuò)誤折疊蛋白應(yīng)激概述
1.2.2 三條UPR通路
1.3 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)的蛋白降解
1.4 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力和腫瘤的關(guān)系
1.4.1 IRE1通路在腫瘤中的作用
1.4.2 PERK通路在腫瘤中的作用
1.4.3 ATF6通路在腫瘤中的作用
1.5 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力和衰老
1.5.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與衰老的關(guān)系
1.5.2 UPR在衰老過(guò)程中的作用
1.6 細(xì)胞老化
1.6.1 復(fù)制性老化和成熟前老化
1.6.2 調(diào)節(jié)細(xì)胞老化的信號(hào)通路和分子機(jī)制
1.6.3 細(xì)胞老化與腫瘤的關(guān)系
1.6.4 細(xì)胞老化和衰老的關(guān)系
1.7 泛素和泛素化系統(tǒng)
1.7.1 泛素和泛素化過(guò)程
1.7.2 泛素化鏈接方式
1.8 泛素化酶CHIP的結(jié)構(gòu)和功能
1.8.1 CHIP的結(jié)構(gòu)
1.8.2 CHIP的功能
1.9 本論文研究的目的
第二章 IRE1結(jié)合蛋白的鑒定與驗(yàn)證
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 IRE1結(jié)合蛋白的免疫沉淀及質(zhì)譜鑒定
2.3.2 IRE1與CHIP相互作用的驗(yàn)證
2.4 小結(jié)
第三章 CHIP對(duì)IRE1作用的分子機(jī)制研究
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 CHIP在體內(nèi)泛素化IRE1
3.3.2 CHIP對(duì)IRE1的泛素化修飾方式的研究
3.4 小結(jié)
第四章 CHIP對(duì)IRE1的激酶活性及信號(hào)通路的影響
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.1 GA引起的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力對(duì)IRE1的激活的影響
4.3.2 CHIP對(duì)IRE1下游相關(guān)通路的影響
4.3.3 IRE1的泛素化修飾對(duì)其激酶活性和IRE1/TRAF2/JNK通路的影響
4.3.4 去泛素化酶OTUB1對(duì)IRE1/TRAF2/JNK通路的影響
4.3.5 CHIP對(duì)其他UPR通路的影響
4.3.5.1 CHIP對(duì)ATF6通路的影響
4.3.5.2 CHIP對(duì)PERK通路的影響
4.4 小結(jié)
第五章 IRE1/TRAF2/JNK通路在細(xì)胞老化過(guò)程中的作用
5.1 引言
5.2 材料與方法
5.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
5.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.3.1 IRE1/TRAF2/JNK通路對(duì)細(xì)胞老化的作用
5.3.2 CHIP在細(xì)胞老化中的作用
5.4 小結(jié)
第六章 討論
基本結(jié)論
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
本文編號(hào):3988672
【文章頁(yè)數(shù)】:108 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
專業(yè)詞匯中英文對(duì)照表
第一章 緒論
1.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的結(jié)構(gòu)和功能
1.1.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的分類與結(jié)構(gòu)
1.1.2 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的功能
1.2 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與錯(cuò)誤折疊蛋白應(yīng)激
1.2.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與錯(cuò)誤折疊蛋白應(yīng)激概述
1.2.2 三條UPR通路
1.3 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)的蛋白降解
1.4 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力和腫瘤的關(guān)系
1.4.1 IRE1通路在腫瘤中的作用
1.4.2 PERK通路在腫瘤中的作用
1.4.3 ATF6通路在腫瘤中的作用
1.5 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力和衰老
1.5.1 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力與衰老的關(guān)系
1.5.2 UPR在衰老過(guò)程中的作用
1.6 細(xì)胞老化
1.6.1 復(fù)制性老化和成熟前老化
1.6.2 調(diào)節(jié)細(xì)胞老化的信號(hào)通路和分子機(jī)制
1.6.3 細(xì)胞老化與腫瘤的關(guān)系
1.6.4 細(xì)胞老化和衰老的關(guān)系
1.7 泛素和泛素化系統(tǒng)
1.7.1 泛素和泛素化過(guò)程
1.7.2 泛素化鏈接方式
1.8 泛素化酶CHIP的結(jié)構(gòu)和功能
1.8.1 CHIP的結(jié)構(gòu)
1.8.2 CHIP的功能
1.9 本論文研究的目的
第二章 IRE1結(jié)合蛋白的鑒定與驗(yàn)證
2.1 引言
2.2 材料與方法
2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.3.1 IRE1結(jié)合蛋白的免疫沉淀及質(zhì)譜鑒定
2.3.2 IRE1與CHIP相互作用的驗(yàn)證
2.4 小結(jié)
第三章 CHIP對(duì)IRE1作用的分子機(jī)制研究
3.1 引言
3.2 材料與方法
3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.3.1 CHIP在體內(nèi)泛素化IRE1
3.3.2 CHIP對(duì)IRE1的泛素化修飾方式的研究
3.4 小結(jié)
第四章 CHIP對(duì)IRE1的激酶活性及信號(hào)通路的影響
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
4.3.1 GA引起的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力對(duì)IRE1的激活的影響
4.3.2 CHIP對(duì)IRE1下游相關(guān)通路的影響
4.3.3 IRE1的泛素化修飾對(duì)其激酶活性和IRE1/TRAF2/JNK通路的影響
4.3.4 去泛素化酶OTUB1對(duì)IRE1/TRAF2/JNK通路的影響
4.3.5 CHIP對(duì)其他UPR通路的影響
4.3.5.1 CHIP對(duì)ATF6通路的影響
4.3.5.2 CHIP對(duì)PERK通路的影響
4.4 小結(jié)
第五章 IRE1/TRAF2/JNK通路在細(xì)胞老化過(guò)程中的作用
5.1 引言
5.2 材料與方法
5.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
5.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
5.3.1 IRE1/TRAF2/JNK通路對(duì)細(xì)胞老化的作用
5.3.2 CHIP在細(xì)胞老化中的作用
5.4 小結(jié)
第六章 討論
基本結(jié)論
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
本文編號(hào):3988672
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