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基于核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)基因的9種蚊蟲分子鑒定

發(fā)布時間:2020-12-09 12:51
  目的分析常見9種蚊蟲核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(rDNA-ITS2)基因序列特征,為蚊蟲種類分子鑒定方法探討提供依據(jù)。方法在山東省濟(jì)寧市采集淡色庫蚊、三帶喙庫蚊、二帶喙庫蚊、白紋伊蚊、刺擾伊蚊、中華按蚊、騷擾阿蚊、常型曼蚊和黃色柯蚊成蚊,形態(tài)學(xué)種類鑒定后,提取上述9種蚊蟲DNA,PCR擴(kuò)增rDNA-ITS2基因并測序;在GenBank中進(jìn)行同源性比對,采用Bioedit 7.0軟件及DNAMAN軟件對測序結(jié)果進(jìn)行比對分析,通過DNASTAR、ClustalX 1.81和Mega6軟件分析列特征并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹探討系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。結(jié)果 9種蚊蟲的rDNAITS2長度在343 bp與577 bp之間,共有59個保守位點(diǎn)、449個變異位點(diǎn)、235個簡約信息位點(diǎn)和191個單態(tài)位點(diǎn),9種蚊蟲種間序列同源性為28.21%~53.76%;所有蚊蟲的rDNA-ITS2基因分子鑒定與形態(tài)學(xué)鑒定吻合率100%,庫蚊屬的淡色庫蚊、三帶喙庫蚊和二帶喙庫蚊聚成一類,伊紋屬的白紋伊蚊和刺擾伊蚊聚成一類,不同種蚊蟲為獨(dú)立分支。結(jié)論核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔(rDNA-ITS2)基因可用于蚊蟲屬和種的鑒定。 

【文章來源】:熱帶病與寄生蟲學(xué). 2020年01期 第12-16頁

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

基于核糖體DNA第二內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)基因的9種蚊蟲分子鑒定


9種蚊種的r DNA-ITS2基因PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果

序列,分子,伊蚊,基因


采用NJ法和UPGMA法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,所有系統(tǒng)數(shù)樹支上數(shù)值為1 000次Bootstrap檢測得到的對該支的支持百分?jǐn)?shù)。從圖中可以看出這兩種不同的分子系統(tǒng)樹具有大致相同的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),庫蚊屬的淡色庫蚊、三帶喙庫蚊和二帶喙庫蚊聚成一類,伊紋屬的白紋伊蚊和刺擾伊蚊聚成一類,但這兩個系統(tǒng)中,騷擾阿蚊、黃色柯蚊、常型曼蚊和中華按蚊的位置有所不同。在NJ樹中,該四種蚊蟲為獨(dú)立分支,而UPGMA樹中,騷擾阿蚊和黃色柯蚊聚為一類(圖2)。討論

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:2906889

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