胭脂魚(Myxocyprinus asiaticus)隸屬于鯉形目、亞口魚科、胭脂魚屬,為國家Ⅱ級重點(diǎn)保護(hù)動物,是亞口魚科分布于我國的單型屬物種,分布于長江和閩江水系。近年來,由于過度捕撈、水域污染、水利工程建設(shè)等人為因素的影響,其資源量急劇下降。閩江水系已經(jīng)很難發(fā)現(xiàn)胭脂魚的蹤跡。為了增加其在長江流域中的資源量,人工增殖放流是其中一個有效的方法。胭脂魚人工養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性是檢測評估胭脂魚子代遺傳品質(zhì)的重要指標(biāo),也是胭脂魚資源保護(hù)的重要環(huán)節(jié)。本研究利用線粒體DNA、微衛(wèi)星以及MHC分子標(biāo)記對瀘州(LZ)、眉山(MS)、萬州(WZ)和宜賓(YB)四個胭脂魚人工養(yǎng)殖群體進(jìn)行遺傳多樣性評估,為胭脂魚的資源保護(hù)和科學(xué)管理提供依據(jù)。主要研究內(nèi)容和結(jié)果如下:1、基于線粒體DNA分子標(biāo)記的胭脂魚遺傳多樣性分析�；诰�粒體DNA(D-loop+Cyt b)獲得總長度為2994bp核苷酸序列。在164尾胭脂魚線粒體序列中檢測出87個變異位點(diǎn)和83個簡約信息位點(diǎn)。同時定義了18個單倍型。單倍型多樣性(h)的變化范圍為0.486-0.835,核苷酸多樣性(π)的變化范圍為0.01052-0.01587。在...

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【學(xué)位級別】：博士

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圖2-1基于線粒體CCR構(gòu)建的4個胭脂魚養(yǎng)殖群體單倍型NJ樹

Hap81Hap94Hap101Hap111CytbHap17171028Hap2557Hap382Hap412Hap51Hap695Hap73124Hap831Hap911Hap....

圖2-2基于CR構(gòu)建的4個胭脂魚養(yǎng)殖群體單倍型NJ樹

圖2-2基于CR構(gòu)建的4個胭脂魚養(yǎng)殖群體單倍型NJ樹ure2-2ThehaplotypeNJtreeoffourM.asiaticusbreedingpopulationbasedo

圖2-3基于Cytb構(gòu)建的4個胭脂魚養(yǎng)殖群體單倍型NJ樹

圖2-3基于Cytb構(gòu)建的4個胭脂魚養(yǎng)殖群體單倍型NJ樹ThehaplotypeNJtreeoffourM.asiaticusbreedingpopulationba簡約網(wǎng)絡(luò)圖個數(shù)據(jù)集分別構(gòu)建了單倍型分布簡約網(wǎng)絡(luò)圖（圖2-4，圖

圖2-4基于CCR在4個胭脂魚養(yǎng)殖群體的單倍型簡約網(wǎng)絡(luò)圖

西南大學(xué)博士學(xué)位論文數(shù)據(jù)集，共定義了18個單倍型。H_1為主型單倍型，圍繞S、LZ的獨(dú)有單倍型。щ在這18個單倍型中獨(dú)有單倍型的獨(dú)有單倍型的頻率最高。圖中出現(xiàn)的紅色節(jié)點(diǎn)，代表還存在（圖2-4）。基于控制區(qū)單倍型的網(wǎng)絡(luò)圖可以看出H_1單倍布，щ所占比例較大。并щ....

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