耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌基因型分析及傳播路徑調(diào)查研究
發(fā)布時間:2025-01-18 10:18
目的:耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)引起的院內(nèi)感染因其高傳播率、高病死率、高耐藥率引起廣泛關注。近年來院內(nèi)CRKP感染的患者逐漸增多,細菌耐藥形勢較為嚴峻。為了防止醫(yī)院內(nèi)CRKP的擴散,了解院內(nèi)感染CRKP的基因型及其進化關系和感染CRKP患者間的傳播路徑關系,為醫(yī)院感染防控提供數(shù)據(jù)支持。方法:收集蚌埠市第三人民醫(yī)院2018年11月至2019年3月CRKP非重復菌株21株,采用梅里埃VITEK微生物鑒定儀進行菌種鑒定、最低抑菌濃度MIC法和藥敏紙片擴散KB法分析菌株對抗菌藥物的敏感性,mCIM實驗聯(lián)合eCIM實驗檢測碳青霉烯酶表型。提取菌株DNA,利用Illumina Hiseq 2500平臺進行全基因組測序、SPAdes軟件進行序列拼接、Staramr軟件分析菌株耐藥基因、MLST軟件分析多位點序列分型(Multilocus sequence typing,MST)、Ridom SeqSphere+軟件進行核心基因組多位點序列分型(core genome multilocus sequence ...
【文章頁數(shù)】:40 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:4028482
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【學位級別】:碩士
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圖319株CRKP的院內(nèi)傳播路徑圖
17圈代表一個菌株基于cgMLST分型2358個靶基因序列的等位基因譜。連接線上的數(shù)字表示不同等位基因的數(shù)量。圓圈的顏色代表不同的CT型,代表CT3176型,代表CT1814型,代表CT1689型,代表CT3195型,代表CT1313型。圖2基于21個肺炎克雷伯菌菌株的cgMLS....
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