目的:探討miR-155-5p在腎母細(xì)胞瘤中的表達(dá)及其靶向調(diào)控IGF2通過PI3K信號通路對腎母細(xì)胞瘤細(xì)胞生物學(xué)行為的影響及作用機(jī)制。方法:1.臨床樣本分析:（1）分別利用miRNA芯片技術(shù)及轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)檢測4例腎母細(xì)胞瘤患者血液樣本中miRNA的表達(dá)以及8例患兒腫瘤和對應(yīng)瘤旁組織中mRNA的表達(dá);（2）收集87例腎母細(xì)胞瘤患兒腫瘤組織及其對應(yīng)的瘤旁組織,采用RT-qPCR驗(yàn)證miR-155-5p及IGF2表達(dá)差異,利用WB和免疫組化實(shí)驗(yàn)檢測IGF2、PI3K、AKT和mTOR蛋白的表達(dá)水平;（3）結(jié)合臨床資料分析miR-155-5p和IGF2表達(dá)量與患者臨床病理特征的相關(guān)性。2.生物信息學(xué)分析:（1）下載GEO和TARGET數(shù)據(jù)庫中腎母細(xì)胞瘤組織mRNA及miRNA芯片數(shù)據(jù),利用R語言篩選差異mRNA和miRNA;（2）利用TargetScan、miRWalk、mirBridge、miRDB、miRNAMap、PicTar等在線預(yù)測網(wǎng)站預(yù)測差異miRNAs的靶向mRNA基因;（3）KEGG富集差異miRNAs靶基因相關(guān)的信號通路及疾病類型,GO注釋和KEGG富集差異mRNAs的功能... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】：89 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

GEO數(shù)據(jù)庫中腎母細(xì)胞瘤的差異miRNAA：GSE57370熱圖；B：GSE61741熱圖

重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文28圖1.1GEO數(shù)據(jù)庫中腎母細(xì)胞瘤的差異miRNAA：GSE57370熱圖；B：GSE61741熱圖Fig.1.1DE-miRNAsinWTbyGEOdatabaseHeatmapsofthetop50DEmiRNAsintheWTgeneexpressiondatasetsA.GSE57370andB.GSE617412.1.2腎母細(xì)胞瘤患兒血液中差異miRNAs的檢測采用miRNA芯片技術(shù)檢測腎母細(xì)胞瘤患兒血液中miRNA表達(dá)情況，結(jié)果發(fā)現(xiàn)24個miRNA表達(dá)上調(diào)，81個miRNA表達(dá)下調(diào)（圖1.2）。圖1.2腎母細(xì)胞瘤患兒血液中的差異miRNA

重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文29A：芯片熱圖；B：芯片圈圖Fig.1.2DE-miRNAsinWTbymiRNAmicroarraymiRNAmicroarrayofdifferentialmiRNAlevelsinWTbloodsamplesrepresentedbyA.heatmapandB.circosplot2.1.3差異miRNAs靶基因富集的通路與疾病利用生物信息學(xué)技術(shù)分析差異miRNA的靶基因發(fā)現(xiàn)，靶基因主要富集在PI3KAKT信號通路、Hippo通路、mTOR通路以及胰島素信號通路等，而富集的疾病主要包括神經(jīng)系統(tǒng)疾并肌肉骨骼系統(tǒng)疾并先天性疾病及腫瘤等（圖1.3）。圖1.3差異miRNA靶基因富集的通路與疾病A：信號通路富集；B：疾病富集Fig.1.3TargetsofDE-miRNAsparticipateinthesignalingpathwayanddiseasetypesaccordingtotheKEGGenrichmentanalysisA.KEGGenrichmentpathwayandB.disease


本文編號：2904239