硫化葉菌Sulfolobus生活在酸熱的極端環(huán)境下,其基因組DNA更容易受到損傷,但硫化葉菌基因組的突變率與溫和環(huán)境中的生物相同,基因組仍然保持穩(wěn)定,說(shuō)明硫化葉菌具有高效的DNA損傷修復(fù)能力。古菌的遺傳信息加工系統(tǒng)中的蛋白復(fù)合物較真核生物相對(duì)簡(jiǎn)單,是一個(gè)“簡(jiǎn)化版本”。利用古菌作為模型研究細(xì)胞對(duì)DNA的加工代謝,能夠?yàn)榱私鈴?fù)雜的真核生物DNA代謝機(jī)制提供參考。許多DNA的損傷可使行進(jìn)的復(fù)制叉在損傷處停滯,細(xì)胞可以通過(guò)復(fù)制叉回退,經(jīng)同源重組修復(fù)受損的DNA,重啟停滯的復(fù)制叉。古菌Hjm (He1308 a)解旋酶參與同源重組修復(fù)途徑,加工處理停滯的復(fù)制叉,回退形成修復(fù)過(guò)程中的重要中間產(chǎn)物Holliday junction結(jié)構(gòu)。Hjm還具有鏈退火活性以及可能在Holliday junction遷移等過(guò)程中起重要作用。Hjm解旋酶的結(jié)構(gòu)域V是一個(gè)酶活性調(diào)控結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域的缺失以及其中保守精氨酸位點(diǎn)的突變導(dǎo)致酶活性的變化。然而,其體內(nèi)功能以及結(jié)構(gòu)域與功能的關(guān)聯(lián)尚不明確。為了研究Hjm的體內(nèi)功能,本研究首先以硫磺礦硫化葉菌Sulfolobus solfataricus的Hjm為模板,使用SWIS...

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１．１?ｓ域系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)（圖片源自美國(guó)伍茲霍爾海泮研究所??ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｗｈｏｉ．ｅｄｕ／ｐａｇｅ．ｄｏ？ｐｉｄ?二?１４９％＜＆ｔｉｄ＝４４１?友?ｃｉｄ＝７４４７４＆ｃｔ＝６１＆ａｒｔｉｃｌｅ＝４６６０６）??

ｓ域系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)（圖片源自美國(guó)伍茲霍爾海泮ｗ．ｗｈｏｉ．ｅｄｕ／ｐａｇｅ．ｄｏ？ｐｉｄ?二?１４９％＜＆ｔｉｄ＝４４１?友?ｃｉｄ＝７４４７４＆ｃｔ＝６１＆ａｒｔｉｃｌｅＦｉｇ．?１．１?Ｔｈｅ?ｐｏｌｙｇｅｎｅｔｉｃ?ｔｒｅｅ?ｏｆ?ｌｉｆｅ?ｗｉｔｈ?ｔｈｒｅｅ?ｄｏｍａｉｎｓ....

圖１．２停滯復(fù)制叉的多種修復(fù)途徑??Ｆｉｇ．?１．２?Ｍ山ｔｉｐｌｅ?ｐａｔｈｗａｙｓ?ｐｒｏｃｅｓｓ?化ｅ?ｓ化ｌｉｅｄ?ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ?ｆｏｒｋ??

序列的ＤＮＡ分子為模板完成修復(fù)同源重組修復(fù)主要包括四個(gè)步驟：一、??３’－ｏｖｅｒｈａｎｇ結(jié)構(gòu)的形成。在古菌中，Ｒａｄ５０、Ｍｒｅｌｌ、ＨｅｒＡ、ＮｕｒＡ等蛋白的協(xié)??同作用下，受損的ＤＮＡ在斷裂處被加工形成３’－ｏｖｅｒｈａｎｇ結(jié)構(gòu)（圖１．３）。ＳＳＢ、??ＲａｄＡ等蛋白結(jié)合在....

圖１．３古菌同源重組修復(fù)途徑ｔ５２ｌ??Ｆｉｇ．?１．３?Ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ?ｒｅｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ?ｒｅｐａｉｒ?ｐａｔｈｗａｙ?ｉ打?ａｒｃｈａｅａ??

ｒｅｓｔａｒｔ?ｃｌｅａｖａｇｅ?ｏｆ?ｆｏｕｒ－ｗａｙ?ｊｕｎｃｔｉｏｎ??圖１．２停滯復(fù)制叉的多種修復(fù)途徑??Ｆｉｇ．?１．２?Ｍ山ｔｉｐｌｅ?ｐａｔｈｗａｙｓ?ｐｒｏｃｅｓｓ?化ｅ?ｓ化ｌｉｅｄ?ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ?ｆｏｒｋ??嚴(yán)重的ＤＮＡ雙鏈斷裂損傷可通過(guò)同源重組途徑....

圖１．５與ＲＮＡ結(jié)合的黑腹果蛹ＤＥｘＤ／Ｈ－ｂｏｘ解旋酶ｖａｓａ的結(jié)構(gòu)

Ｌｏｏｐ區(qū)一端具有ＡＴＰ結(jié)合位點(diǎn)、另一端具有ＲＮＡ或ＤＮＡ結(jié)合位點(diǎn)［８３１。??結(jié)構(gòu)域１、２?Ｗ及它們之間的ｌｏｏｐ共同組成了解旋酶的核屯、區(qū)域，能夠?qū)﹄p鏈螺??旋解旋或通過(guò)ＡＴＰ的水解形成ＲＮＡ／ＤＮＡ－蛋白復(fù)合物（圖１．５）。??ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ?ＡＴＰ?Ｓ．?ｃｅ....

本文編號(hào)：3993875