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小麥脫水蛋白全基因組分析及WZY2與其缺失體的功能研究

發(fā)布時(shí)間:2025-01-18 17:02
  非生物脅迫影響著植物生長(zhǎng),甚至導(dǎo)致植株死亡,而脫水蛋白是一種高度親水性、熱穩(wěn)定性的天然無序蛋白,在植物抵抗非生物脅迫中發(fā)揮著重要作用。在之前的研究中,我們已經(jīng)克隆出了小麥YnSKn型脫水蛋白WZY2,證明了其在體外可以保護(hù)LDH酶的活性,并且在非生物脅迫下可以有效提高大腸桿菌的存活率。在本研究中,我們共發(fā)現(xiàn)了49個(gè)小麥(Triticum aestivum)脫水蛋白家族的成員,其中包括之前一些沒有研究過的新的脫水蛋白。我們利用保守序列分析、染色體定位、基因重復(fù)事件、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)分析、亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)及表達(dá)模式分析來揭示小麥脫水蛋白家族的特征;并將YnSKn型脫水蛋白及其缺失體在擬南芥中過表達(dá)來研究其功能。結(jié)果表明,這些脫水蛋白都是小分子的親水性蛋白,多數(shù)都屬于YnSKn亞家族(73.5%);這些脫水蛋白基因均位于染色體長(zhǎng)臂與短臂的頭部,均含有較少的內(nèi)含子并且內(nèi)含子的位置與長(zhǎng)度都相對(duì)保守,以適應(yīng)快速表達(dá)調(diào)控的需要;這些脫水蛋白不同亞族之間高度保守,基因重復(fù)是其在進(jìn)化過程中向基因組擴(kuò)增的主要手段。小麥脫水蛋白在植株不同組織及在不同脅迫下的表達(dá)具有多樣性。YnSKn型脫水蛋白在小麥的胚和...

【文章頁數(shù)】:64 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1WZY2及其保守片段示意圖

圖2-1WZY2及其保守片段示意圖

qPCRSuperMixNuclease-freeWater107Totalvolume20反應(yīng)體系為:95℃3min;95℃15s60℃30s40cycles72℃20sqPCR引物由Primer3V.0.4.0設(shè)計(jì)(http://bioinfo.ut....


圖3-1小麥脫水蛋白的保守片段紫色表示保守片段Y,紅色和青色表示保守片段K,綠色表示保守片段S,橙色表示保守片段φ

圖3-1小麥脫水蛋白的保守片段紫色表示保守片段Y,紅色和青色表示保守片段K,綠色表示保守片段S,橙色表示保守片段φ

17圖3-1小麥脫水蛋白的保守片段紫色表示保守片段Y,紅色和青色表示保守片段K,綠色表示保守片段S,橙色表示保守片段φ。Figure3-1.TheconservedmotifsofwheatdehydrinsPurpleindicatesY-segm....


圖3-2MEME輸出的小麥脫水蛋白的5個(gè)保守片段的LOGO

圖3-2MEME輸出的小麥脫水蛋白的5個(gè)保守片段的LOGO

18圖3-2MEME輸出的小麥脫水蛋白的5個(gè)保守片段的LOGO。Figure3-2.LOGOrepresentationoftheMEMEoutputofthefivemotifsofwheatdehy3.2小麥脫水蛋白的理化性質(zhì)、染色體....


圖3-3小麥脫水蛋白的染色體定位(A)位于A染色體組長(zhǎng)臂上的脫水蛋白;(B)位于D染色體組長(zhǎng)臂上的脫水蛋白;(C)位于B染色體組長(zhǎng)臂上的脫水蛋白;(D)位于染色體組短臂上的脫水蛋白;(E)小麥脫水蛋白在A、B和D染色體組上的分布;(F)小麥脫水蛋白在不同染色體上的分布

圖3-3小麥脫水蛋白的染色體定位(A)位于A染色體組長(zhǎng)臂上的脫水蛋白;(B)位于D染色體組長(zhǎng)臂上的脫水蛋白;(C)位于B染色體組長(zhǎng)臂上的脫水蛋白;(D)位于染色體組短臂上的脫水蛋白;(E)小麥脫水蛋白在A、B和D染色體組上的分布;(F)小麥脫水蛋白在不同染色體上的分布

西北農(nóng)林科技大學(xué)碩士學(xué)位論文有的小麥脫水蛋白基因均定位位于基因組的0.3Mb之前,所以我們選擇分別顯示A,B,D染色體長(zhǎng)臂和短臂的一部分(0到0.3Mb)。這些脫水蛋白的數(shù)量幾乎均勻地分布在A、B和D基因組中,但在每個(gè)基因組中這些蛋白均主要分布在第5和第....



本文編號(hào):4028887

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