有性生殖的維持和進(jìn)化一直受到生物學(xué)家的關(guān)注,目前關(guān)于異質(zhì)環(huán)境促進(jìn)有性生殖進(jìn)化的少量證據(jù)都是在實(shí)驗(yàn)室人工模擬的結(jié)果,因時(shí)間跨度不夠長和環(huán)境成分簡單而受到質(zhì)疑。滇池是云南有名的淡水湖泊,該湖泊不僅受到嚴(yán)重的氮磷污染,同時(shí)重金屬含量也高于云南省土壤背景值,是天然的異質(zhì)環(huán)境。彎孢節(jié)叢孢Arthrobotrys musiformis屬于子囊菌門Ascomycota圓盤菌科Orbiliaceae,圓盤菌屬Orbilia的無性態(tài),廣泛分布于各種生境中,既能進(jìn)行有性生殖,也能進(jìn)行無性繁殖,是研究生境對真菌有性生殖影響的良好材料。本研究選取從滇池底泥(簡稱為DC)、滇池旁的西山農(nóng)田土壤(XS)、圓盤菌屬子囊孢子(S)分離的三個(gè)A.musiformis 群體為研究材料,從線粒體基因組多樣性的角度揭示異質(zhì)環(huán)境對A.musiformi 的遺傳分化及有性生殖的影響。主要研究結(jié)果如下:1.A.musiforis 的系統(tǒng)發(fā)育分析聯(lián)合ITS,RPB2和TEF三個(gè)片段,對48個(gè)A.musiformis 菌株進(jìn)行系統(tǒng)學(xué)分析的結(jié)果顯示,所有該種菌株都聚成一支,和同屬的外群少孢節(jié)叢孢A.oligospora差異明顯,證明所選菌...

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 線粒體在群體遺傳中學(xué)中的應(yīng)用
        1.1.1 真菌線粒體基因組的研究概況
        1.1.2 線粒體DNA作為生物多樣性標(biāo)記原因
        1.1.3 真菌線粒體基因組的遺傳多態(tài)性和進(jìn)化速率
            1.1.3.1 基于RFLP標(biāo)記的研究
            1.1.3.2 基于多位點(diǎn)序列的研究
            1.1.3.3 基于完整的線粒體基因組序列分析的研究
    1.2 捕食線蟲真菌群體遺傳學(xué)研究進(jìn)展
    1.3 異質(zhì)環(huán)境對真菌基因組多樣性的影響
    1.4 真菌的交配型基因
    1.5 真菌有性生殖和異質(zhì)環(huán)境的聯(lián)系
    1.6 本研究的主要目標(biāo)
第二章 實(shí)驗(yàn)材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)菌株
    2.2 實(shí)驗(yàn)材料
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
        2.2.2 實(shí)驗(yàn)器材
        2.2.3 培養(yǎng)基
    2.3 試驗(yàn)方法
        2.3.1 實(shí)驗(yàn)菌株DNA的提取
        2.3.2 目的片段的擴(kuò)增
            2.3.2.1 擴(kuò)增引物
            2.3.2.2 擴(kuò)增體系
            2.3.2.3 擴(kuò)增程序
        2.3.3 數(shù)據(jù)分析
            2.3.3.1 PCR產(chǎn)物的檢測及測序
            2.3.3.2 序列的拼接、比對
            2.3.3.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.3.4 MAT基因的獲取
            2.3.4.1 數(shù)據(jù)獲取
            2.3.4.2 數(shù)據(jù)組裝及分析
        2.3.5 線粒體基因組的獲取
            2.3.5.1 線粒體基因組的測序
            2.3.5.2 線粒體基因組序列拼接
            2.3.5.3 線粒體基因組注釋
            2.3.5.4 線粒體基因組的提交
            2.3.5.5 線粒體基因組的分析
            2.3.5.6 基于線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析
第三章 結(jié)果與分析
    3.1 多基因聯(lián)合確定種
        3.1.1 三個(gè)基因的獲得片段統(tǒng)計(jì)
        3.1.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.1.3 討論
    3.2 交配型基因分析
        3.2.1 討論
    3.3 彎孢節(jié)叢孢(A. musiformis)線粒體基因組結(jié)構(gòu)
        3.3.1 A.musiformis YMF 1.01900 S
        3.3.2 A.musiformis YMF 1.03721 DC
        3.3.3 A.musiformis YMF 1.03753 XS
    3.4 三株A.musiformis線粒體基因組對比分析及討論
        3.4.1 基于線粒體基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.4.2 三株彎孢節(jié)叢孢線粒體基因組總覽
            3.4.2.1 NADH1多位點(diǎn)核苷酸突變驗(yàn)證
            3.4.2.2 NADH5及NADH6內(nèi)含子存在/缺失驗(yàn)證
        3.4.3 相對同義密碼子使用對比(RSCU)
        3.4.4 線粒體基因組比對的可視化分析
        3.4.5 討論
第四章 全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
碩士學(xué)位期間完成的科研成果
致謝



本文編號(hào)：4005636