花椰菜轉錄因子ERF056的克
發(fā)布時間:2024-07-11 04:47
AP2/ERF轉錄因子在植物中廣泛存在,其在植物生長發(fā)育及逆境應答過程中均發(fā)揮重要作用。但目前對花椰菜中AP2/ERF轉錄因子及其功能知之甚少。本研究利用前期花椰菜轉錄組數(shù)據(jù),采用RT-PCR等方法從花椰菜中分離并克隆得到一個AP2/ERF轉錄因子:ERF056;蛐蛄屑胺肿犹卣鞣治鼋Y果表明,花椰菜ERF056全長741 bp,編碼246個氨基酸,具有一個AP2/ERF結構域,其編碼產(chǎn)物為疏水性蛋白,無跨膜結構,內部以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主。聚類分析結果顯示,花椰菜ERF056與油菜和甘藍中相應轉錄因子具有較高相似性。轉錄表達譜分析結果顯示,ERF056在花椰菜不同組織中均有表達,其中花球中表達量最高。鹽脅迫表達特征分析表明,花椰菜ERF056在鹽脅迫條件下呈下調表達,暗示其負向響應鹽脅迫。相關研究為深入揭示花椰菜ERF056在鹽脅迫應答中的功能及調控機制提供了幫助。
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
本文編號:4005272
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圖1花椰菜ERF056基因全長編碼序列的PCR擴增
在NCBI的CDD數(shù)據(jù)庫中對ERF056轉錄因子進行保守結構域預測,ERF056轉錄因子具有一個AP2/ERF保守結構域,該結果進一步證實花椰菜ERF056屬于ERF亞家族(圖2A)。使用在線分析軟件ProtParam,對花椰菜ERF056進行一級結構預測,結果顯示,花椰菜ERF....
圖2花椰菜ERF056氨基酸序列分子特征分析
圖1花椰菜ERF056基因全長編碼序列的PCR擴增1.3花椰菜ERF056轉錄因子系統(tǒng)進化分析
圖4不同物種ERF056轉錄因子motifs分析
目前已有多篇關于ERF在鹽脅迫下的表達模式分析研究。研究表明:油菜BnaERF-B3-hyl5受鹽、干旱、低溫誘導表達,轉BnaERF-B3-hyl5擬南芥抗冷凍能力提高(姜海華等,2010);花生AhERF6在低溫、干旱、高鹽脅迫下均受到明顯誘導,過表達AhERF6提高耐低溫和....
圖5不同物種ERF056轉錄因子系統(tǒng)進化分析
圖4不同物種ERF056轉錄因子motifs分析3材料與方法
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