AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子在植物中廣泛存在,其在植物生長發(fā)育及逆境應(yīng)答過程中均發(fā)揮重要作用。但目前對花椰菜中AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子及其功能知之甚少。本研究利用前期花椰菜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用RT-PCR等方法從花椰菜中分離并克隆得到一個AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子:ERF056�；�因序列及分子特征分析結(jié)果表明,花椰菜ERF056全長741 bp,編碼246個氨基酸,具有一個AP2/ERF結(jié)構(gòu)域,其編碼產(chǎn)物為疏水性蛋白,無跨膜結(jié)構(gòu),內(nèi)部以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主。聚類分析結(jié)果顯示,花椰菜ERF056與油菜和甘藍(lán)中相應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子具有較高相似性。轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜分析結(jié)果顯示,ERF056在花椰菜不同組織中均有表達(dá),其中花球中表達(dá)量最高。鹽脅迫表達(dá)特征分析表明,花椰菜ERF056在鹽脅迫條件下呈下調(diào)表達(dá),暗示其負(fù)向響應(yīng)鹽脅迫。相關(guān)研究為深入揭示花椰菜ERF056在鹽脅迫應(yīng)答中的功能及調(diào)控機(jī)制提供了幫助。

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圖1花椰菜ERF056基因全長編碼序列的PCR擴(kuò)增

在NCBI的CDD數(shù)據(jù)庫中對ERF056轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測，ERF056轉(zhuǎn)錄因子具有一個AP2/ERF保守結(jié)構(gòu)域，該結(jié)果進(jìn)一步證實花椰菜ERF056屬于ERF亞家族(圖2A)。使用在線分析軟件ProtParam，對花椰菜ERF056進(jìn)行一級結(jié)構(gòu)預(yù)測，結(jié)果顯示，花椰菜ERF....

圖2花椰菜ERF056氨基酸序列分子特征分析

圖1花椰菜ERF056基因全長編碼序列的PCR擴(kuò)增1.3花椰菜ERF056轉(zhuǎn)錄因子系統(tǒng)進(jìn)化分析

圖4不同物種ERF056轉(zhuǎn)錄因子motifs分析

目前已有多篇關(guān)于ERF在鹽脅迫下的表達(dá)模式分析研究。研究表明：油菜BnaERF-B3-hyl5受鹽、干旱、低溫誘導(dǎo)表達(dá)，轉(zhuǎn)BnaERF-B3-hyl5擬南芥抗冷凍能力提高(姜海華等,2010)；花生AhERF6在低溫、干旱、高鹽脅迫下均受到明顯誘導(dǎo)，過表達(dá)AhERF6提高耐低溫和....

圖5不同物種ERF056轉(zhuǎn)錄因子系統(tǒng)進(jìn)化分析

圖4不同物種ERF056轉(zhuǎn)錄因子motifs分析3材料與方法

本文編號：4005272