DNA甲基化酶家族生物信息學(xué)分析及其在尼羅羅非魚中的表達和功能初探
發(fā)布時間:2024-06-11 23:24
表觀遺傳學(xué)研究在不改變DNA序列下的可遺傳改變,DNA甲基化是表觀遺傳學(xué)研究的重要內(nèi)容之一。以往的研究表明DNA甲基化在魚類的性別決定和分化過程中具有重要作用,DNA甲基化酶在此過程中發(fā)揮的作用仍不清楚,本研究分析了DNA甲基化酶在脊椎動物中的系統(tǒng)進化及其成員擴增與動物全基因組復(fù)制的關(guān)系,并研究了DNA甲基化酶家族成員在尼羅羅非魚不同組織、不同發(fā)育時期雌魚(卵巢)和雄魚(精巢)性腺以及由雌轉(zhuǎn)雄次發(fā)性逆轉(zhuǎn)過程中的表達。此外,在離體條件下,采用DNA甲基化酶抑制劑5-氮雜-2-脫氧胞苷(5-aza-dC)體外孵育羅非魚性腺組織,研究了抑制劑處理對DNA甲基化酶以及雌、雄通路關(guān)鍵基因表達的影響;在在體條件下,采用不同濃度梯度5-aza-dC浸浴或腹腔注射仔稚魚,研究了抑制劑處理對羅非魚幼魚骨骼發(fā)育和性腺分化的影響,初步評估了DNA甲基化酶在尼羅羅非魚發(fā)育過程中的功能。主要研究結(jié)果如下:1)本研究在尼羅羅非魚基因組中鑒定了7個DNA甲基化酶家族成員,包括dnmt1、dnmt2、dnmt3aa、dnmt3ab、dnmt3ba、dnmt3bb.1和dnmt3bb.2,此外還從海鞘、象鯊、腔棘魚、爪...
【文章頁數(shù)】:73 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 文獻綜述
1 魚類性別決定與性腺分化
1.1 魚類的性別
1.2 魚類的性別決定方式
1.3 魚類的性別分化
2 DNA甲基化
2.1 DNA甲基化機制
2.2 DNA甲基化與基因表達調(diào)控
2.3 DNA甲基化酶分類及成員
2.4 DNA甲基化酶結(jié)構(gòu)與功能
2.5 DNA甲基化酶在脊椎動物的表達模式
2.6 DNA甲基化和DNA甲基化酶與性腺發(fā)育
3 科學(xué)問題的提出和本研究的目的意義
第2章 DNA甲基化酶家族生物信息學(xué)分析及表達研究
1 引言
2 材料和方法
2.1 實驗魚
2.2 DNA甲基化酶家族成員鑒定
2.3 DNA甲基化酶家族系統(tǒng)發(fā)育分析及基因定位
2.4 DNA甲基化酶家族共線性分析
2.5 DNA甲基化酶家族成員在羅非魚中的時空表達模式分析
2.6 DNA甲基化酶家族成員表達模式驗證
3 結(jié)果
3.1 尼羅羅非魚DNA甲基化酶鑒定
3.2 DNA甲基化酶系統(tǒng)進化分析
3.3 DNA甲基化酶家族成員共線性分析
3.4 DNA甲基化酶在羅非魚中的時空表達模式
3.5 DNA甲基化酶表達模式驗證結(jié)果分析
4 討論
4.1 DNA甲基化酶家族成員的分離、系統(tǒng)發(fā)生及共線性
4.2 從頭甲基化酶在羅非魚性腺中的表達具有性差
4.3 DNA甲基化酶復(fù)制基因在羅非魚中的表達模式發(fā)生分歧
第3章 DNA甲基化酶在羅非魚性腺發(fā)育中的功能
1 引言
2 材料和方法
2.1 實驗動物
2.2 主要試劑和儀器
2.3 實驗方法
3 結(jié)果
3.1 抑制劑體外孵育對甲基化酶基因和性腺分化關(guān)鍵基因表達的影響
3.2 抑制劑浸浴后羅非魚畸形率和死亡率統(tǒng)計
3.3 抑制劑腹腔注射后羅非魚性腺組織學(xué)檢測
4 討論
4.1 DNA甲基化酶抑制劑體外孵育上調(diào)性腺分化關(guān)鍵基因的表達
4.2 DNA甲基化酶抑制劑浸浴導(dǎo)致羅非魚畸形率和死亡率增加
4.3 DNA甲基化酶抑制劑腹腔注射使雌性羅非魚性逆轉(zhuǎn)
第4章 結(jié)論
本研究的不足與展望
參考文獻
致謝
在讀期間發(fā)表論文
在讀期間參加科研情況
本文編號:3992869
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【學(xué)位級別】:碩士
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第1章 文獻綜述
1 魚類性別決定與性腺分化
1.1 魚類的性別
1.2 魚類的性別決定方式
1.3 魚類的性別分化
2 DNA甲基化
2.1 DNA甲基化機制
2.2 DNA甲基化與基因表達調(diào)控
2.3 DNA甲基化酶分類及成員
2.4 DNA甲基化酶結(jié)構(gòu)與功能
2.5 DNA甲基化酶在脊椎動物的表達模式
2.6 DNA甲基化和DNA甲基化酶與性腺發(fā)育
3 科學(xué)問題的提出和本研究的目的意義
第2章 DNA甲基化酶家族生物信息學(xué)分析及表達研究
1 引言
2 材料和方法
2.1 實驗魚
2.2 DNA甲基化酶家族成員鑒定
2.3 DNA甲基化酶家族系統(tǒng)發(fā)育分析及基因定位
2.4 DNA甲基化酶家族共線性分析
2.5 DNA甲基化酶家族成員在羅非魚中的時空表達模式分析
2.6 DNA甲基化酶家族成員表達模式驗證
3 結(jié)果
3.1 尼羅羅非魚DNA甲基化酶鑒定
3.2 DNA甲基化酶系統(tǒng)進化分析
3.3 DNA甲基化酶家族成員共線性分析
3.4 DNA甲基化酶在羅非魚中的時空表達模式
3.5 DNA甲基化酶表達模式驗證結(jié)果分析
4 討論
4.1 DNA甲基化酶家族成員的分離、系統(tǒng)發(fā)生及共線性
4.2 從頭甲基化酶在羅非魚性腺中的表達具有性差
4.3 DNA甲基化酶復(fù)制基因在羅非魚中的表達模式發(fā)生分歧
第3章 DNA甲基化酶在羅非魚性腺發(fā)育中的功能
1 引言
2 材料和方法
2.1 實驗動物
2.2 主要試劑和儀器
2.3 實驗方法
3 結(jié)果
3.1 抑制劑體外孵育對甲基化酶基因和性腺分化關(guān)鍵基因表達的影響
3.2 抑制劑浸浴后羅非魚畸形率和死亡率統(tǒng)計
3.3 抑制劑腹腔注射后羅非魚性腺組織學(xué)檢測
4 討論
4.1 DNA甲基化酶抑制劑體外孵育上調(diào)性腺分化關(guān)鍵基因的表達
4.2 DNA甲基化酶抑制劑浸浴導(dǎo)致羅非魚畸形率和死亡率增加
4.3 DNA甲基化酶抑制劑腹腔注射使雌性羅非魚性逆轉(zhuǎn)
第4章 結(jié)論
本研究的不足與展望
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