迄今為止,已經(jīng)鑒定出了450多種獨(dú)特的蛋白質(zhì)修飾,包括磷酸化、乙酰化、泛素化和小泛素化,它們是具有許多生物學(xué)功能的細(xì)胞蛋白質(zhì)的調(diào)節(jié)機(jī)制,并且在許多原核和真核蛋白質(zhì)的功能調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用。在這些PTMs中,乙�；�是一種動態(tài)且高度保守的翻譯后修飾,在調(diào)節(jié)多種細(xì)胞過程中起著關(guān)鍵的作用。由于乙�；�在某些相關(guān)的生物學(xué)過程中的重要作用,它成為最重要的可逆蛋白翻譯后修飾之一。異常的乙�；�蛋白質(zhì)與許多病理疾病有關(guān),如癌癥,神經(jīng)性疾病和代謝性疾病,所以進(jìn)一步了解乙�；�蛋白質(zhì)對以后的分析乙酰化機(jī)理和相關(guān)的實驗驗證,藥物開發(fā)提供指導(dǎo)性意義。蛋白質(zhì)的功能常有標(biāo)注KW,GO,Smart,Pfam,InterPro,PRINT,PROSITE,SUPFAM分析得出,乙酰化蛋白質(zhì)在正負(fù)樣本中差距較大,正樣本的功能標(biāo)注信息含有蛋白質(zhì)的數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于負(fù)樣本,且KW,GO信息量遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于其他Smart,Pfam,InterPro,PRINT,PROSITE,SUPFAM的信息量。人類蛋白質(zhì)6832條蛋白質(zhì)中,正樣本有3404條,負(fù)樣本有3428條,正負(fù)樣本基本持平。關(guān)鍵詞中乙�；�關(guān)鍵詞在正樣本中有3392條。在GO信息統(tǒng)計分析...

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2.1SVM的原理圖[39]

如乙酰化，磷酸化，泛素化和甲基化。SV，其通過將輸入樣本映射到更高維的空間并搜到最大邊緣超平面以最小化分類錯誤。SVM模S形函數(shù)的SVM模型相當(dāng)于雙層感知器神經(jīng)邊界，SVM會嘗試最大化類之間的邊距，并空間的中某些已知點的分類是,則其被定的輸入空間的點，則其中....

圖2.3神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)圖

學(xué)習(xí)的好處是用非監(jiān)督或半監(jiān)督的特征學(xué)特征。深入學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)是機(jī)器學(xué)習(xí)中分表示假定觀測值是由不同的銀子相互作用這一互相作用的過程可分為多個層次，代DeepNeualNetworks，DNN）是一種判。權(quán)重更新可以用隨機(jī)梯度下降法求解：(1)()ijijijcwtw....

圖3.1不同關(guān)鍵詞乙�；�修飾條數(shù)其中X軸是14個關(guān)鍵詞，Y軸是含有乙酰化關(guān)鍵詞的蛋白質(zhì)條數(shù)

330N-ACETYLGLYCINEN-乙酰甘氨酸4787N-ACETYLMETHIONINEN-乙�；�蛋氨酸522N-ACETYLPROLINEN-乙酰脯氨酸6403N-ACETYLSERINEN-乙酰絲氨酸778N-ACETYLTHREON....

圖3.2統(tǒng)計關(guān)鍵詞正負(fù)樣本非乙�；�修飾其中X軸代表正負(fù)樣本關(guān)鍵詞，Y軸代表含有正負(fù)樣本關(guān)鍵詞的蛋白質(zhì)條數(shù)，其中綠色代表正樣本關(guān)鍵詞，紅色代表負(fù)樣本關(guān)鍵詞

28TRANSPORTTRANSPORT運(yùn)輸4431429ACTIVATORACTIVATOR活化劑2033130ACYLTRANSFERASEACYLTRANSFERASE酰基轉(zhuǎn)移酶521831ALTERNATIVESPLICINGALTERNATIVE....

本文編號：3991016