發(fā)布時間：2024-06-12 00:08

　　腸炎病是海馬人工養(yǎng)殖過程中常見病害,主要是細菌感染而引起的,其傳染性強、危害性高。因此,解析患腸炎病海馬腸道中的細菌菌群組成對于海馬腸炎病的診斷以及防治有著重要意義。采集健康和患腸炎病的膨腹海馬腸道組織,采用細菌16Sr DNA片段高通量測序和生物信息學分析手段,探究患腸炎病海馬的腸道細菌結(jié)構(gòu)特征。結(jié)果表明,健康和腸炎病海馬之間的腸道菌群多樣性和結(jié)構(gòu)均存在顯著差異。從屬水平上來看,患病海馬的腸道優(yōu)勢菌種為弧菌屬Vibrio、漫游球菌屬Vagococcus、分枝桿菌屬Mycobacterium,健康海馬的腸道優(yōu)勢菌種為玫瑰菌屬Roseibium、擬桿菌目-未分類Bacteroidales_unclassified、弧菌屬Vibrio、嗜冷菌屬Psychrobacter,健康海馬和患病海馬中的共有屬包括弧菌屬Vibrio、別弧菌屬Aliivibrio、擬桿菌目-未分類Bacteroidetes_unclassified、發(fā)光桿菌屬Photobacterium。與健康海馬腸道菌群相比,患病海馬腸道中的弧菌屬Vibrio、別弧屬菌屬Aliivibrio的...

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【部分圖文】：

圖5健康與患病海馬腸道的差異細菌菌群

為了進一步解析健康與患病海馬在屬水平上的細菌群落組成的差異性，將兩組樣本利用STAMP進行顯著性差異分析。由圖5可以看出，健康海馬與患病海馬存在明顯差異，在患病海馬中，弧菌屬Vibrio、漫游球菌屬Vagococcus、分枝桿菌屬Mycobacterium、黃桿菌屬Tenacib....

圖1腸道DNAPCR擴增結(jié)果

對于健康與患病海馬腸道提取總細菌DNA后，使用細菌特異性引物進行了PCR擴增，結(jié)果如圖1所示。從圖1可見，6個樣品的PCR產(chǎn)物條帶大小正確，并且總量符合測序建庫要求。進一步使用illuminaHiseq進行上機測序，6個樣品得到的數(shù)據(jù)統(tǒng)計如表1所示。對6個樣品的測序數(shù)據(jù)經(jīng)過OT....

圖3基于屬水平的健康與患病海馬腸道菌群相對豐度

其次，在細菌分類的屬水平上，共鑒定出19個主要屬。其中患病海馬的腸道優(yōu)勢菌種為弧菌屬Vibrio、漫游球菌屬Vagococcus、分枝桿菌屬Mycobacterium、β變形菌綱-未分類Betaproteobacteria＿unclassified、黃桿菌屬Tenacibacul....

圖4主成分分析不同樣品群落結(jié)構(gòu)

為了解析健康與患病海馬腸道的細菌群落組成的差異性，將所有的6個樣品根據(jù)OTU的類型進行了主成分分析，結(jié)果如圖4所示。從圖4可以看出，所有的6個樣品可以明顯分成2群，一群為健康海馬腸道樣品，另一群為患病海馬腸道樣品，表明2群樣品之間有明顯的差異性。其中健康海馬腸道樣品聚類較為集中，....

本文編號：3992920