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大菱鲆炎癥小體關(guān)鍵組件分子SmASC的抗細(xì)菌感染功能

發(fā)布時間:2020-11-18 00:35
   先天性免疫是宿主抵御病原菌感染的第一道防線,是機(jī)體內(nèi)至關(guān)重要的系統(tǒng)性響應(yīng)元件之一,其不僅可以防止感染和維持生理平衡,還對激活適應(yīng)性免疫應(yīng)答至關(guān)重要。在先天性免疫激活的過程中,炎癥小體通過激活細(xì)胞焦亡從而誘發(fā)炎癥反應(yīng)發(fā)生是近年來被解析的關(guān)鍵信號。在哺乳動物中,炎癥小體主要由三個組件所組成:Nod樣受體蛋白、接頭蛋白凋亡相關(guān)斑點樣顆粒(Apoptosis associated speck like protein containing CARD,ASC)和效應(yīng)蛋白。接頭蛋白ASC在炎癥小體激活過程中作為該組件的關(guān)鍵的連接分子,主要包含兩個結(jié)構(gòu)域:PYD結(jié)構(gòu)域和CARD結(jié)構(gòu)域。當(dāng)上游受體蛋白識別到外源/內(nèi)源性刺激信號后,可通過PYD-PYD的同源相互作用來招募ASC,然后通過其CARD結(jié)構(gòu)域?qū)YD形成的絲狀結(jié)構(gòu)壓縮成斑點,并招募pro-caspase-1,誘導(dǎo)IL-1beta和IL-18等炎癥因子的成熟和釋放。然而,在硬骨魚中,炎癥小體激活介導(dǎo)細(xì)胞焦亡的分子機(jī)制還有待進(jìn)一步研究,因此,本論文擬以海水養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)魚種大菱鲆為研究對象,鑒定介導(dǎo)炎癥小體激活的關(guān)鍵組件,并解析其抗細(xì)菌感染分子機(jī)制,尋找有效的關(guān)鍵分子靶標(biāo),為水產(chǎn)養(yǎng)殖魚類的病害防控提供新思路。本論文以哺乳動物上已經(jīng)鑒定的相關(guān)炎癥小體激活分子為基礎(chǔ),通過RACE技術(shù)克隆得到大菱鲆炎癥小體激活的相關(guān)調(diào)控基因,包括SmGSDME、caspase-3和SmASC。通過多序列比對和進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn),不同物種中GSMDE的N端相對保守,其中大菱鲆的SmGSMDE和大黃魚的DFNA5親緣最為接近,且在N端具有一段親膜結(jié)構(gòu)域。而caspase-3的序列在整個生物進(jìn)化過程中相對保守,且與許氏平鲇caspase-3的親緣關(guān)系最近,其沒有跨膜結(jié)構(gòu)域。同時,大菱鲆的ASC和哺乳動物的ASC結(jié)構(gòu)高度保守,均具有典型的PYD和CARD結(jié)構(gòu)域,并且,從進(jìn)化角度,其和牙鲆的ASC的親緣關(guān)系最近。鑒于ASC在炎癥小體組件形成過程中發(fā)揮的重要橋接功能,本論文擬進(jìn)一步探索SmASC的功能。首先,經(jīng)過表達(dá)SmASC蛋白后,采用DSS交聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),SmASC蛋白能夠形成典型的寡聚化特征。其次,在HEK293T細(xì)胞中過表達(dá)SmASC蛋白后,采用免疫熒光分析發(fā)現(xiàn),SmASC蛋白能夠在細(xì)胞內(nèi)形成斑點狀結(jié)構(gòu),并且PYD和CARD結(jié)構(gòu)域在ASC寡聚化過程中均發(fā)揮了關(guān)鍵作用。然后,進(jìn)一步分析了大菱鲆不同臟器中SmASC的轉(zhuǎn)錄水平發(fā)現(xiàn)其主在肝和肌肉中具有相對高的表達(dá)。最后,我們通過細(xì)菌腹腔注射感染發(fā)現(xiàn),鰻弧菌和殺魚愛德華氏菌侵染大菱鲆均能夠誘導(dǎo)SmASC在不同器官中出現(xiàn)顯著上調(diào)表達(dá),顯示其在抗細(xì)菌感染過程中可能發(fā)揮了重要功能。為了進(jìn)一步探索SnASC在抗細(xì)菌感染分子機(jī)制,本論文采用活體注射siRNA對大菱鲆SmASC進(jìn)行敲降后,通過殺魚愛德華氏菌腹腔注射感染發(fā)現(xiàn),SmASC敲降魚體中細(xì)菌的定植顯著增加。其次,采用活體注射SmASC過表達(dá)質(zhì)粒后,通過殺魚愛德華氏菌腹腔注射感染發(fā)現(xiàn),SmASC過表達(dá)魚體中細(xì)菌的定植量顯著減少。綜合上述結(jié)果,本論文揭示了SmASC在大菱鲆抗細(xì)菌感染過程中發(fā)揮了重要的作用,為進(jìn)一步鑒定大菱鲆的受體蛋白并解析其下游效應(yīng)蛋白在抗感染先天免疫應(yīng)答中發(fā)揮的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
【學(xué)位單位】:華東理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S943
【部分圖文】:

炎癥,信號,結(jié)構(gòu)域,小體


華東理工大學(xué)碩士學(xué)位論文?第5頁??同上面兩種炎癥小體不同的是NLRC4受體由三個結(jié)構(gòu)域組成,包括N端的CARD,??中間的NBD以及C端的LRR。因為有CARD結(jié)構(gòu)域,而沒有PYD結(jié)構(gòu)域,NLPC4炎??癥小體的組裝不需要接頭蛋白ASC,但是在ASC存在的情況能夠增強(qiáng)炎癥反應(yīng),同時??也有證據(jù)表明缺少ASC后,NLRC4通過CARD-CARD相互作用招募pro-caspase-1,足??夠引發(fā)caspase-1和GSDMD引發(fā)的細(xì)胞焦亡,但是沒有IL-lb/IL-18的成熟丨371。另外,??LRR在NLRC4激活過程中起抑制作用,因為NLRC4缺少丨,RR結(jié)構(gòu)域后也能激活??caspase-1。目前鑒定到NLRC4的激活劑有三種:細(xì)菌的鞭毛、三型分泌系統(tǒng)的通道蛋??白和基座蛋白[38]。在NLRC4炎癥小體激活過程中,NA1P蛋白發(fā)揮著重要的功能,細(xì)菌??的鞭毛蛋白、三型分泌系統(tǒng)的通道蛋白和基座蛋白不能被NLRC4所識別,需要在NAIP??蛋白的幫助F形成復(fù)合體,使NLRC4的構(gòu)象發(fā)生改變,暴露出來的CARD結(jié)構(gòu)域與??pro-caspase-1相互作用,組裝成NLRC4炎癥小體使caspase-丨成熟,引發(fā)下游的炎癥反??應(yīng)【38,39]。??

序列,瓊脂糖凝膠電泳,大菱鲆,斑馬魚


—i??0?10??圖2.4以AJ法構(gòu)建的*SmDFNA5進(jìn)化樹??Fig.?2.4?Phylogenetic?tree?of?57WDFNA5?constructed?by?neighbor-joining?method.??2.4.2大菱鲆cav/^ye-J基因的克隆??根據(jù)哺乳動物和斑馬魚基因的序列比對信息,在序列保守序部分設(shè)計引??物,以大菱鲆的cDNA為模板獲得大菱鲆ca■S77m?e-J的保守序列,其大小為?504?bp(圖??2.7)。然后,通過5’?RACE和3’?RACE獲得該基因的未知片段,大小分別為347?bp和??633?bp?(圖?2.7)。??然后

序列,進(jìn)化樹,大菱鲆


250?bp??1〇〇?bp??圖2.3?DFNA5瓊脂糖凝膠電泳圖??Fig.?2.3?Agarose?electrophoresis?of?.S,/wDFNA5.??99??Paralichthys?oiivaceus??72?r ̄???Anabas?testuctneus??61廠?^???Lates?calcanfer??55???Monopterus?albus??83??—?LanmicntHys?crocea???AScophtha/mus?maxim?us???MastacembeJus?arwatus???Oreocfiromis?ruloticus???T〇D ̄?I?Mdiylsincia?zebra??100?1?Pundamtlia?nyererei??i—i??0?10??圖2.4以AJ法構(gòu)建的*SmDFNA5進(jìn)化樹??Fig.?2.4?Phylogenetic?tree?of?57WDFNA5?constructed?by?neighbor-joining?method.??2.4.2大菱鲆cav/^ye-J基因的克隆??根據(jù)哺乳動物和斑馬魚基因的序列比對信息,在序列保守序部分設(shè)計引??物,以大菱鲆的cDNA為模板獲得大菱鲆ca■S77m?e-J的保守序列,其大小為?504?bp(圖??2.7)。然后,通過5’?RACE和3’?RACE獲得該基因的未知片段,大小分別為347?bp和??633?bp?(圖?2.7)。??然后,經(jīng)過序列拼接得到大菱鲆基因全長,其中?
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本文編號:2888111

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