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基于ISSR分子標(biāo)記對(duì)蒙古沙冬青遺傳多樣性研究

發(fā)布時(shí)間:2020-12-02 13:19
  蒙古沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)屬于豆科沙冬青屬(Ammopiptanthus)常綠闊葉灌木,也是阿拉善荒漠地區(qū)特有且唯一的超旱生常綠闊葉灌木,作為古地中海第三紀(jì)孑遺植物,已被列為國(guó)家三級(jí)珍稀瀕危保護(hù)植物。沙冬青種群分布呈現(xiàn)出斑塊狀分布,其分布區(qū)由于地處于生態(tài)系統(tǒng)脆弱、極端氣候多發(fā)地帶,以及人類(lèi)活動(dòng)等原因,種群數(shù)量發(fā)生明顯下降的趨勢(shì)。因此探尋氣候變化下種群遺傳結(jié)構(gòu)與其遺傳多樣性,不僅對(duì)合理利用沙冬青遺傳資源及育種具有重要的參考價(jià)值,而且在研究不同微生境下沙冬青的進(jìn)化方向和其生長(zhǎng)地區(qū)的環(huán)境的關(guān)系方面也具有指導(dǎo)意義,為后續(xù)對(duì)沙冬青的其它研究奠定了基礎(chǔ)。具體研究結(jié)果如下:1.通過(guò)正交試驗(yàn)法對(duì)沙冬青的ISSR-PCR反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化。確定了沙冬青的最佳反應(yīng)體系(20μ L)為:10μL mix、1 μL引物、5μL DNA模板、4uL水。以該體系為基礎(chǔ)對(duì)引物進(jìn)行篩選,從哥倫比亞大學(xué)公布的100條通用引物中共篩選出15條適合沙冬青擴(kuò)增的引物,分別為UBC808、UBC826、UBC827、UBC856、UBC857、UBC888、UBC889和UBC890,并利用... 

【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于ISSR分子標(biāo)記對(duì)蒙古沙冬青遺傳多樣性研究


圖1技術(shù)路線(xiàn)圖??Fig.?1?Technology?Roadmap??

分布圖,沙冬青,采樣點(diǎn),分布圖


樣本被帶入實(shí)驗(yàn)室超低溫保存直至DNA的萃取,見(jiàn)表1。??表1沙冬青采樣種群??Tabl?The?sampling?populations?of?Ammopiptanthus?mongolicus??種群?種群來(lái)源?m.?諱度?海拔?樣本編號(hào)??ALSZNRG?阿拉善左旗諾閂公?104。53'44.7"?40°?1030"?1411.83?1-20??EJNYG?額濟(jì)納雅桿?103°13,12"?41°37'37"?1001.62?2?M0??ALSYSHT?阿拉善右旗蘇海圖?106°33'42〃?40°09,10,>?1059.18?41-60??HLS?賀蘭山?106。01'57"?39〇03,1,,1?2047.98?61-80??DK?巴彥淖爾磴口?40。25'43"?1055.8?81-100??ALSZCHE?阿拉善左旗查哈爾?105。49,49,,?3902825"?1146.03?101-120??WLTH?烏拉特后旗?106。33,42"?41°16,29"?1821.85?121-140??ALSY?P?可拉善右旗?101。45,17"?39。16,50"?1594.97?141-160??WH?烏海?106。39,49"?39°34,54"?1113.65?161-180??WLTQ?烏拉特前旗?108。40’57"?40。4328"?1184.20?181-200??

流程圖,沙冬青,生物氣候


?脹因子(VIF)分析來(lái)減少多重共線(xiàn)性[68]。去除具有高VTF值(VIF>10)的變量,??然后計(jì)算保留的生物氣候變量在種群中的環(huán)境距離用于測(cè)試IBE假設(shè)(圖5)。通??過(guò)計(jì)算確定影響沙冬青種群遺傳結(jié)構(gòu)的最可能的環(huán)境因素。??通過(guò)Mantel?(或部分Mantel)測(cè)試進(jìn)行模型選擇以評(píng)估19個(gè)模型,每個(gè)生物??氣候距離作為MLPE中的固定因子。這些單生物氣候距離IBE模型按AIC排序,??具有最低AIC的模型被認(rèn)為是預(yù)測(cè)種群遺傳結(jié)構(gòu)的最佳模型。??進(jìn)行IBD假說(shuō)模型時(shí),將遺傳距離用作響應(yīng),地理距離用作預(yù)測(cè)因子,環(huán)境??距離用作條件因子。??具體操作步驟可見(jiàn)影響種群遺傳結(jié)構(gòu)的環(huán)境因素的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)流程圖(圖2)。??(a)從數(shù)據(jù)庫(kù)中提取生物氣候?qū);(b)使用方差膨脹因子(VIF)分析去除具??多重共線(xiàn)性的因子(層):丟棄VIF>?10的因子;(c)通過(guò)部分Mantel檢驗(yàn)將剩??余的生物氣候因子(bio3,bio4,bio6和biol8)與遺傳距離相關(guān)聯(lián),并找出關(guān)鍵的??生物氣候因子(biol8)?;?(d)最終確定與關(guān)鍵生物氣候因素(biol2,biol3,biol6??和biol8)相關(guān)的因素。??a?b??下載19個(gè)氣象數(shù)據(jù)資料?去除共線(xiàn)性因子??????:..'丨.*?參??:蕓:VIF分析-?減???z??c?d??分析影響遺彳雜構(gòu)的?確定最終影響因子??氣候因子??tft?Mmumt??....?|u?’?』?3??Mantel檢,.旬?.,?r?.??驗(yàn)?■??.=

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]中國(guó)北部和蒙古國(guó)山羽蘚遺傳多樣性及五大連池火山群山羽蘚譜系地理學(xué)的研究[D]. 麻揚(yáng).內(nèi)蒙古大學(xué) 2018
[2]基于SSR和ISSR梁子湖野生菰種質(zhì)資源遺傳多樣性研究[D]. 董琳.江西財(cái)經(jīng)大學(xué) 2018
[3]阿拉善荒漠區(qū)沙冬青種群特征與遺傳多樣性[D]. 李梓豪.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]線(xiàn)葉忍冬群落學(xué)特征及線(xiàn)葉忍冬繁殖特性[D]. 李亞蘭.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]沙冬青繁殖行為與種群自組織更新[D]. 趙新艷.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009



本文編號(hào):2895378

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