發(fā)布時(shí)間：2024-11-24 22:06

　　黃萎病菌是侵染棉花造成產(chǎn)量和品質(zhì)損失的重要病害,棉花抗黃萎病以往的研究進(jìn)展都是在編碼蛋白基因?qū)用嫔蠈?duì)抗病機(jī)制進(jìn)行的分析。本課題對(duì)棉花基因組中的非編碼RNA和編碼蛋白的基因同時(shí)進(jìn)行研究,以鑒定和分析參與棉花黃萎病抗性相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA和與黃萎病抗性有密切關(guān)系的類受體蛋白基因家族。另外,我們利用三代測(cè)序,完成了黃萎病菌基因組組裝,擬從黃萎病菌基因組變異的角度考察黃萎病菌與棉花的互作關(guān)系。取得主要結(jié)果如下:首先,該研究從全基因組水平描述了lncRNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)響應(yīng)黃萎病菌入侵的概貌,闡述了lncRNA在棉花與大麗輪枝菌互作中的作用。研究發(fā)現(xiàn)lncRNA在不同棉種中響應(yīng)病原侵染具有保守特性和特異性,但被病原誘導(dǎo)的lncRNA在海島棉和陸地棉兩個(gè)棉種中都具有在Dt亞基因組優(yōu)勢(shì)表達(dá)的特點(diǎn)。這表明異源四倍體棉花中共存的兩個(gè)亞基因組在響應(yīng)病原侵染時(shí)存在偏向性誘導(dǎo)表達(dá),這與前人認(rèn)為棉花對(duì)黃萎病的抗性可能源于D亞基因組相符。研究還發(fā)現(xiàn),物種保守的核心lncRNA和物種特異lncRNA在基因組變異和表達(dá)上存在明顯差異。物種特異lncRNA具有更多SNP變異...

【文章頁(yè)數(shù)】：132 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１．１植物免疫系統(tǒng)的示意圖（引自Ｄａｎｇｌ?ｅｔ?ａｌ?２０１３）

第二層防御系統(tǒng)ＰＴＩ作為誘導(dǎo)性抗性的其中一種，是一個(gè)被植物細(xì)胞膜表面??的病程相關(guān)分子模式（Ｐａｔｈｏｇｅｎ－ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ?ｍｏｌｅｃｕｌａｒ?ｐａｔｔｅｒｎ，ＰＡＭＰｓ）所誘導(dǎo)的??機(jī)制（圖１．１）。這個(gè)機(jī)制可以識(shí)別在多種類型病原菌中進(jìn)化上相對(duì)保守的結(jié)構(gòu)，??如細(xì)菌的鞭....

圖１．２常見(jiàn)模式識(shí)別受體及其所招募的調(diào)控受體激酶和胞質(zhì)類受體激酶（引自Ｃｏｕｔｏ?ａｎｄ??Ｚｉｐｆｅｌ?２０１６）〇??

（ｆｒｏｍ?Ｃｏｕｔｏ?ａｎｄ?Ｚｉｐｆｅｌ?２０１６）．??病原與寄主之間存在共進(jìn)化關(guān)系。當(dāng)植物ＰＴＩ被激活后，病原體會(huì)進(jìn)化出效??應(yīng)子（Ｅｆｆｅｃｔｏｒ）來(lái)破壞依賴ＰＲＲ的免疫機(jī)制（圖１．１）。不同的效應(yīng)子可能會(huì)針??對(duì)特定的亞細(xì)胞位置或結(jié)構(gòu)，促進(jìn)自身獲取植物的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，并促....

圖１．４模式圖示棉花黃萎�。ǎ耍祝幔祝鳎恚颍妫幔停妫欤澹�導(dǎo)致的萎蔫，發(fā)育遲緩和葉萎黃化

棉花黃萎�。ǎ郑澹颍簦椋悖椋欤椋酰恚鳎椋欤簦┦怯纱罅妮喼�菌引起的??一種真菌性病害。我國(guó)棉花生產(chǎn)經(jīng)常受到黃萎病為害，導(dǎo)致棉花萎蔫，發(fā)育遲緩，??葉萎黃化和壞死，從而導(dǎo)致棉花產(chǎn)量減產(chǎn)和纖維品質(zhì)下降（圖１．４）。??Ｍ??圖１．４模式圖示棉花黃萎病（ＫＷａＷｗｍｒｆａＭｆｌｅ）導(dǎo)致的....

圖２．１用于構(gòu)建ＶＩＧＳ的ＩｎｃＲＮＡ和蛋白質(zhì)編碼基因的引物位置和設(shè)計(jì)方案

基因的位置不能重疊。ＩｎｃＮＡＴｓ及其配對(duì)的蛋白質(zhì)編碼基因總是存在彼此重疊的??一些區(qū)域，因此我們?cè)O(shè)計(jì)了特異性引物（避免重疊和保守區(qū)域）去擴(kuò)増?zhí)禺惼��??來(lái)構(gòu)建ＶＩＧＳ載體，如方案設(shè)計(jì)中所示，以確保每個(gè)基因的沉默特異性（圖２．１?）。??Ｌ２／Ｐ２?Ｇｅｎｏｍｉｃ?Ｌｏｃａｔｉｏ....

本文編號(hào)：4012535