生物與互聯(lián)網(wǎng)數(shù)據(jù)的結(jié)合推動了醫(yī)學(xué)界的發(fā)展,癌癥和腫瘤的些許案例取得了突破性的進展,為人類社會帶來了巨大的福祉。國內(nèi)外掀起了研究生物統(tǒng)計的熱潮。研究胰腺循環(huán)腫瘤細(xì)胞在生物學(xué)上有極大意義。此外,在生物學(xué)意義上,許多癌癥患者缺乏前期風(fēng)險診斷,但是癌癥有多種風(fēng)險種類。而對于同種癌癥的不同種分型給予相同的治療方案和臨床療法會得到完全不同的療效反應(yīng)。從而揭示了即使同種癌癥的同一種風(fēng)險評級分類也或許會存在潛在的分子層面的不同。本文的主要內(nèi)容是在所獲取的胰腺循環(huán)腫瘤細(xì)胞基因芯片的基礎(chǔ)上,利用改進過的社會網(wǎng)絡(luò)指數(shù)隨機圖模型進行聚類分析和研究。在胰腺癌的研究過程中發(fā)現(xiàn),循環(huán)腫瘤細(xì)胞,即Circulating tumor cells(CTCs),可導(dǎo)致惡性腫瘤發(fā)生遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)移及復(fù)發(fā),為了研究不同細(xì)胞下面的基因的差異表達以及細(xì)胞間異質(zhì)性對于基因功能表達的干擾,尤其是研究胰腺循環(huán)腫瘤細(xì)胞下的基因在導(dǎo)致胰腺癌的過程中扮演了何種角色,我們利用了混合社會網(wǎng)絡(luò)指數(shù)隨機圖模型結(jié)合了細(xì)胞間異質(zhì)性進行聚類分析,并且篩選出了不同細(xì)胞間的差異基因,得到胰腺循環(huán)細(xì)胞、癌細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞、白細(xì)胞四類細(xì)胞下的對比得到的差異基因所在的類別,就... 

【文章來源】：青島大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：42 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

無監(jiān)督層次聚類

青島大學(xué)碩士學(xué)位論文來自 MEF，NB508 胰腺癌細(xì)胞系和正常 WBC 的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組緊密聚集，支持RNA-seq 策略的分析可靠性。鑒定了候選 CTC 的三種不同的聚類模式，所有這些聚類模式都與匹配的原發(fā)性腫瘤序列和癌細(xì)胞系不同。主成分分析顯示了這些不同群體的聚類和相互關(guān)系圖 3.2。

圖 3.2 單細(xì)胞樣品的主成分分析從以上聚類圖我們可以看出，不同細(xì)胞下的基因聚類類別不同，我們的七類細(xì)胞為原發(fā)性胰腺腫瘤細(xì)胞 Tumor 和癌細(xì)胞系 NB508 中、胚胎成纖維細(xì)胞 MEF和正常白細(xì)胞 WBC、經(jīng)典 CTC 細(xì)胞 CTC-c、非經(jīng)典 CTC 簇（葉狀腫瘤細(xì)胞 CTC-plt和 CTC-pro）。細(xì)胞是由基因表達的差異性導(dǎo)致的聚類結(jié)果的不統(tǒng)一，為了進一步研究基因之間的表達，我們篩選出具有影響力的前 500 個基因，細(xì)胞包含的基因排序如下圖 3.3。


本文編號：2902240