生物與互聯(lián)網(wǎng)數(shù)據(jù)的結(jié)合推動(dòng)了醫(yī)學(xué)界的發(fā)展,癌癥和腫瘤的些許案例取得了突破性的進(jìn)展,為人類社會(huì)帶來了巨大的福祉。國內(nèi)外掀起了研究生物統(tǒng)計(jì)的熱潮。研究胰腺循環(huán)腫瘤細(xì)胞在生物學(xué)上有極大意義。此外,在生物學(xué)意義上,許多癌癥患者缺乏前期風(fēng)險(xiǎn)診斷,但是癌癥有多種風(fēng)險(xiǎn)種類。而對(duì)于同種癌癥的不同種分型給予相同的治療方案和臨床療法會(huì)得到完全不同的療效反應(yīng)。從而揭示了即使同種癌癥的同一種風(fēng)險(xiǎn)評(píng)級(jí)分類也或許會(huì)存在潛在的分子層面的不同。本文的主要內(nèi)容是在所獲取的胰腺循環(huán)腫瘤細(xì)胞基因芯片的基礎(chǔ)上,利用改進(jìn)過的社會(huì)網(wǎng)絡(luò)指數(shù)隨機(jī)圖模型進(jìn)行聚類分析和研究。在胰腺癌的研究過程中發(fā)現(xiàn),循環(huán)腫瘤細(xì)胞,即Circulating tumor cells(CTCs),可導(dǎo)致惡性腫瘤發(fā)生遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)移及復(fù)發(fā),為了研究不同細(xì)胞下面的基因的差異表達(dá)以及細(xì)胞間異質(zhì)性對(duì)于基因功能表達(dá)的干擾,尤其是研究胰腺循環(huán)腫瘤細(xì)胞下的基因在導(dǎo)致胰腺癌的過程中扮演了何種角色,我們利用了混合社會(huì)網(wǎng)絡(luò)指數(shù)隨機(jī)圖模型結(jié)合了細(xì)胞間異質(zhì)性進(jìn)行聚類分析,并且篩選出了不同細(xì)胞間的差異基因,得到胰腺循環(huán)細(xì)胞、癌細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞、白細(xì)胞四類細(xì)胞下的對(duì)比得到的差異基因所在的類別,就... 

【文章來源】：青島大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：42 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

無監(jiān)督層次聚類

青島大學(xué)碩士學(xué)位論文來自 MEF，NB508 胰腺癌細(xì)胞系和正常 WBC 的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組緊密聚集，支持RNA-seq 策略的分析可靠性。鑒定了候選 CTC 的三種不同的聚類模式，所有這些聚類模式都與匹配的原發(fā)性腫瘤序列和癌細(xì)胞系不同。主成分分析顯示了這些不同群體的聚類和相互關(guān)系圖 3.2。

圖 3.2 單細(xì)胞樣品的主成分分析從以上聚類圖我們可以看出，不同細(xì)胞下的基因聚類類別不同，我們的七類細(xì)胞為原發(fā)性胰腺腫瘤細(xì)胞 Tumor 和癌細(xì)胞系 NB508 中、胚胎成纖維細(xì)胞 MEF和正常白細(xì)胞 WBC、經(jīng)典 CTC 細(xì)胞 CTC-c、非經(jīng)典 CTC 簇（葉狀腫瘤細(xì)胞 CTC-plt和 CTC-pro）。細(xì)胞是由基因表達(dá)的差異性導(dǎo)致的聚類結(jié)果的不統(tǒng)一，為了進(jìn)一步研究基因之間的表達(dá)，我們篩選出具有影響力的前 500 個(gè)基因，細(xì)胞包含的基因排序如下圖 3.3。


本文編號(hào)：2902240