慢性乙型肝炎患者IFN-α治療無應答與肝組織基因表達差異關系的初步研究
發(fā)布時間:2020-12-03 00:44
目的:利用基因芯片技術檢測慢性乙型肝炎患者α干擾素(IFN-α)治療應答者(Rs)和無應答者(NRs)之間肝組織的表達基因差異,探討IFN-α治療慢乙肝無應答的分子機制。方法:采用表達譜基因芯片檢測IFN-α治療前患者肝組織的全基因表達情況,篩選出在7例治療無應答者和6例治療應答者之間差異表達的基因,對這些差異基因進行Gene Ontology分析和KEGG通路分析,并對部分明顯差異表達基因進行實時熒光定量PCR驗證。結(jié)果:在NRs和Rs組共篩選出3592個差異表達基因(P <0 .05),而這些差異基因主要集中在干擾素誘導基因(ISGs)和免疫調(diào)節(jié)相關基因,且ISGs在治療前的NRs高表達而免疫調(diào)節(jié)相關基因低表達。其中,處于一條抑制干擾素信號通路的兩個ISGs(USP18和CEB1)在NRs高表達,而具有潛在抗病毒活性的ISG20基因在NRs低表達,這可能和IFN-α治療無應答密切相關。結(jié)論:NRs和Rs在IFN-α治療前即具有不同的肝臟基因表達譜,在治療前高表達具有抑制IFN通路的ISGs并抑制免疫反應將預示著治療無應答,并可望在治療前成功預測IFN-α治療效果。
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學重慶市
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
熒光標記反應示意圖
圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Image異表達基因篩選結(jié)果 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個差異表達基因(P 值和 FDR 均<0.05,數(shù)>1.3),其中 1556 個基因在 IFN-α 治療前的 NRs 組高表達,而 2036達。利用 Cluster3.0 軟件進行無監(jiān)督遺傳聚類分析,發(fā)現(xiàn)這 3592 個差分為兩個聚類,在無應答組是一個聚類而在應答組是另一個聚類(見圖可以說明這 3592 個基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異的。
圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Ima2.3 差異表達基因篩選結(jié)果在 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個差異表達基因(P差異倍數(shù)>1.3),其中 1556 個基因在 IFN-α 治療前的 NRs因低表達。利用 Cluster3.0 軟件進行無監(jiān)督遺傳聚類分析因可以分為兩個聚類,在無應答組是一個聚類而在應答組因此,可以說明這 3592 個基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Cloning,Eukaryotic Expression of Human ISG20 and Preliminary Study on the Effect of Its Anti-HBV[J]. 郝友華,楊東亮. Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2008(01)
[2]Relationship of human leukocyte antigen class II genes with the susceptibility to hepatitis B virus infection and the response to interferon in HBV-infected patients[J]. Yong-Nian Han, Jin-Long Yang, Shui-Gen Zheng, Qun Tang, Wei Zhu, Research Unit of Liver Diseases, Shanghai 8~(th) People’s Hospital, Shanghai 200235, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(36)
[3]In vitro resistance to interferon of hepatitis B virus with precore mutation[J]. Yan Wang, Lai Wei, Dong Jiang, Xu Cong, Ran Fei, Jiang Xiao, Yu Wang, Hepatology Institute, Peking University People’s Hospital, Beijing 100044, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
[4]慢性乙型肝炎干擾素療效與人類白細胞抗原-等位基因的關系[J]. 奚敏,臧國慶,馮明亮,季蕓. 中華傳染病雜志. 2004(04)
[5]Gene expression profiles in an hepatitis B virus transfected hepatoblastoma cell line and differentially regulated gene expression by interferon-α[J]. Xun Wang Zheng-Hong Yuan Ling-Jie Zheng Wei Xiong JiangXia Liu,Department of Molecular Virology,Shanghai Medical College,Fudan University,Shanghai 200032,ChinaFeng Yu Gen-Xi Hu,Institute of Biochemistry and Cell Biology,CAS,Shanghai 20003 I,ChinaYao Li,State Key Laboratory of Genetics,Fudan University School of Life Science,Shanghai 200433,China. World Journal of Gastroenterology. 2004(12)
[6]基因芯片分析干擾素對乙型肝炎病毒轉(zhuǎn)染細胞基因表達的影響(英文)[J]. 熊煒,王迅,劉曉穎,項黎,鄭玲潔,劉江霞,袁正宏. 生物化學與生物物理學報. 2003(12)
[7]丙型肝炎病毒基因型及患者人類白細胞抗原對其抗病毒療效的影響[J]. 焦健,王江濱. 中華肝臟病雜志. 2003(10)
[8]粘病毒抵抗蛋白A和真核細胞起始因子2α調(diào)節(jié)區(qū)2基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎干擾素治療效果的相關性[J]. 黃雁翔,馬麗娜,陳新月,李卓,黃云麗,沈成利,馬冰. 中華肝臟病雜志. 2007 (03)
本文編號:2895713
【文章來源】:重慶醫(yī)科大學重慶市
【文章頁數(shù)】:49 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
熒光標記反應示意圖
圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Image異表達基因篩選結(jié)果 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個差異表達基因(P 值和 FDR 均<0.05,數(shù)>1.3),其中 1556 個基因在 IFN-α 治療前的 NRs 組高表達,而 2036達。利用 Cluster3.0 軟件進行無監(jiān)督遺傳聚類分析,發(fā)現(xiàn)這 3592 個差分為兩個聚類,在無應答組是一個聚類而在應答組是另一個聚類(見圖可以說明這 3592 個基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異的。
圖 2 總 RNA 電泳圖Figure 2 Electrophoresis Ima2.3 差異表達基因篩選結(jié)果在 Rs 組和 NRs 組共篩選出 3592 個差異表達基因(P差異倍數(shù)>1.3),其中 1556 個基因在 IFN-α 治療前的 NRs因低表達。利用 Cluster3.0 軟件進行無監(jiān)督遺傳聚類分析因可以分為兩個聚類,在無應答組是一個聚類而在應答組因此,可以說明這 3592 個基因在 NRs 和 Rs 是有顯著差異
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Cloning,Eukaryotic Expression of Human ISG20 and Preliminary Study on the Effect of Its Anti-HBV[J]. 郝友華,楊東亮. Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2008(01)
[2]Relationship of human leukocyte antigen class II genes with the susceptibility to hepatitis B virus infection and the response to interferon in HBV-infected patients[J]. Yong-Nian Han, Jin-Long Yang, Shui-Gen Zheng, Qun Tang, Wei Zhu, Research Unit of Liver Diseases, Shanghai 8~(th) People’s Hospital, Shanghai 200235, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(36)
[3]In vitro resistance to interferon of hepatitis B virus with precore mutation[J]. Yan Wang, Lai Wei, Dong Jiang, Xu Cong, Ran Fei, Jiang Xiao, Yu Wang, Hepatology Institute, Peking University People’s Hospital, Beijing 100044, China. World Journal of Gastroenterology. 2005(05)
[4]慢性乙型肝炎干擾素療效與人類白細胞抗原-等位基因的關系[J]. 奚敏,臧國慶,馮明亮,季蕓. 中華傳染病雜志. 2004(04)
[5]Gene expression profiles in an hepatitis B virus transfected hepatoblastoma cell line and differentially regulated gene expression by interferon-α[J]. Xun Wang Zheng-Hong Yuan Ling-Jie Zheng Wei Xiong JiangXia Liu,Department of Molecular Virology,Shanghai Medical College,Fudan University,Shanghai 200032,ChinaFeng Yu Gen-Xi Hu,Institute of Biochemistry and Cell Biology,CAS,Shanghai 20003 I,ChinaYao Li,State Key Laboratory of Genetics,Fudan University School of Life Science,Shanghai 200433,China. World Journal of Gastroenterology. 2004(12)
[6]基因芯片分析干擾素對乙型肝炎病毒轉(zhuǎn)染細胞基因表達的影響(英文)[J]. 熊煒,王迅,劉曉穎,項黎,鄭玲潔,劉江霞,袁正宏. 生物化學與生物物理學報. 2003(12)
[7]丙型肝炎病毒基因型及患者人類白細胞抗原對其抗病毒療效的影響[J]. 焦健,王江濱. 中華肝臟病雜志. 2003(10)
[8]粘病毒抵抗蛋白A和真核細胞起始因子2α調(diào)節(jié)區(qū)2基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎干擾素治療效果的相關性[J]. 黃雁翔,馬麗娜,陳新月,李卓,黃云麗,沈成利,馬冰. 中華肝臟病雜志. 2007 (03)
本文編號:2895713
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