矽肺是吸入二氧化硅粉塵顆粒所致的以肺間質纖維化為主的全身性疾病。早期健康監(jiān)護是矽肺防治的關鍵環(huán)節(jié),但至目前尚無有效的早期健康監(jiān)護指標。探討矽肺的發(fā)病機制和探索發(fā)現(xiàn)血清早期診斷(篩檢)的生物標志物,對預防、治療乃至最終消除矽肺具有重要的經(jīng)濟和社會意義。近年蛋白質組學技術特別是質譜技術的發(fā)展為矽肺診斷開拓了新領域,一種新的應用功能磁珠、基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)和ClinProTools軟件包組成的ClinProt系統(tǒng)以其高敏感性和可重復性被用于血清蛋白質表達譜的研究[1]。利用磁珠分離、去除樣品中的高豐度蛋白和其他雜質,同時富集低豐度目的蛋白。經(jīng)飛行時間質譜測定得到在矽塵暴露人群和正常對照組之間表達差異的蛋白質,為尋找矽肺生物標記物提供重要的的線索。如何從高通量的血清蛋白質譜數(shù)據(jù)中篩選出可能的疾病早期標志物,是應用質譜技術進行疾病分析的的前提。本研究采用液體蛋白芯片飛行時間質譜作為檢測手段,將Relief算法、遺傳算法結合支持向量機(SVM)應用于MALDI-TOF-MS質譜數(shù)據(jù),構建矽塵暴露人群診斷模型,篩選早期矽肺血清蛋白生物標志物,其拓展的分析技術...

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1無塵肺0期與正常對照組對比軟件自動提取可用峰Fig.1TheselectedpeaksbyClinprotools

mixture(4pmol/ul)按1:5混勻后點1ul，待干燥后點1ul基質。（3）參數(shù)設置：采用線性陽離子模式，第一離子源25KV，第二離子源23.45KV，檢測范圍800-10000Da。每個樣品點四個靶點，每個點100shots，選8個不同位置累計80....

圖2無塵肺0期與正常對照組對比Gelview圖譜

統(tǒng)計學意義的差異蛋白，本研究中采用了Clinprotools軟件內(nèi)置的QC(QuickClassifier)算法和SNN(SupervisedNeuralNetwork)算法。4結果1)無塵肺0期與正常對照組比較分析圖....

圖3無塵肺0期與正常對照組對比模型結果示意圖

圖3無塵肺0期與正常對照組對比模型結果示意圖Fig.3TheperformanceofmodelbuildingbyClinprotools由圖3所示在無塵肺0期與正常對照組對比，Clinprotools軟件利用神經(jīng)SNN和快速分類算法QC....

圖4無塵肺0+期與正常對照組對比軟件自動提取可用峰Fig.4TheselectedpeaksbyClinprotools

圖3無塵肺0期與正常對照組對比模型結果示意圖Fig.3TheperformanceofmodelbuildingbyClinprotools由圖3所示在無塵肺0期與正常對照組對比，Clinprotools軟件利用神經(jīng)網(wǎng)絡算法SNN和快速分類算法....

本文編號：3991292