Koutango病毒TaqMan反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)方法的建立
發(fā)布時間:2024-04-24 23:54
目的建立Koutango病毒(KOUTV)的實(shí)時熒光定量TaqMan反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)檢測方法。方法從GenBank中下載KOUTV基因序列,進(jìn)行多序列比對分析,針對NS5基因中的高保守序列片段設(shè)計(jì)KOUTV的特異引物與探針,用4科9種病毒進(jìn)行檢測方法特異性驗(yàn)證,通過平行重復(fù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證檢測方法穩(wěn)定性,利用體外轉(zhuǎn)錄的RNA標(biāo)準(zhǔn)品建立了KOUTV的NS5基因拷貝數(shù)的絕對定量分析模型。結(jié)果引物與探針工作特異性良好,同一樣品重復(fù)檢測循環(huán)閾值(Ct)的變異系數(shù)均小于1.5%,定量分析模型靈敏度達(dá)到1.0×102拷貝/反應(yīng)。通過本研究建立的快速檢測方法對新疆采集的112批,6 328只蚊蟲進(jìn)行了測定,結(jié)果均為陰性。結(jié)論成功建立了KOUTV的高特異性、高敏感性的TaqMan RT-PCR檢測方法,可應(yīng)用于實(shí)驗(yàn)室和臨床診斷。
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本文編號:3963692
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結(jié)果圖1KOUTV檢測體系特異性驗(yàn)證結(jié)果Figure1EvaluationofspecificityofTaqManRT-PCRassayforKOUTVdetection表2KOUTV檢測體系重復(fù)穩(wěn)定性
2.4檢測體系穩(wěn)定性7個不同濃度(1×102~1×108拷貝/反應(yīng))RNA樣品的3次平行重復(fù)實(shí)驗(yàn),各樣品Ct值的s值均小于0.5,CV值均小于1.5%(表2),這表明該檢測體系穩(wěn)定性良好。2.5蚊蟲樣本檢測采集112批次共6328只蚊蟲,對標(biāo)本研磨液提取RNA后,利用建立的Taq....
圖2KOUTV基因拷貝數(shù)定量分析標(biāo)準(zhǔn)曲線Figure2StandardcurveofKOUTVTaqMan
UTVdetection稀釋度Ct值ˉxsCV(%)第1輪第2輪第3輪1×10814.3914.4514.4314.420.020.141×10716.4016.4516.4316.430.020.121×10619.6120.0620.0819.920.221.101×1052....
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