目的采用ITS2(Internal transcribed spacer2,內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2)序列作為條形碼技術(shù)對(duì)菊科藥用植物進(jìn)行鑒別。方法選取來(lái)自西藏自治區(qū)及四川康定、樂(lè)山和峨眉地區(qū)的菊科樣品44種,提取DNA并對(duì)其進(jìn)行PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))擴(kuò)增,后測(cè)序,測(cè)序結(jié)果提交至GenBank;同時(shí)從GenBank上下載17條樣本序列。使用MEGA7.0軟件計(jì)算所提交和下載的61條序列的種內(nèi)與種間遺傳距離,采用鄰接法(neighbor-joinging,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)聚類樹直觀反應(yīng)鑒定結(jié)果。從ITS2數(shù)據(jù)庫(kù)中預(yù)測(cè)并比較樣本ITS2序列的二級(jí)結(jié)構(gòu)差異。結(jié)果菊科植物種間最小遺傳距離0.031大于種內(nèi)最大遺傳距離0.009,有較明顯的barcoding gap;NJ樹顯示種各屬樣本分別聚為一大枝,種內(nèi)之間各自聚成小支,表現(xiàn)出良好的單系性;各屬及各種樣品ITS2二級(jí)結(jié)構(gòu)存在明顯差異。結(jié)論以ITS2序列作為DNA條形碼,能夠?qū)湛扑幱弥参镞M(jìn)行準(zhǔn)確、迅速的識(shí)別與鑒定,是物種間進(jìn)化關(guān)系準(zhǔn)確的分子鑒定依據(jù),可為該科植物的分布、種群及種群數(shù)量的研究提供指導(dǎo),為...

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【文章目錄】：
1 材料
2 方法
    2.1 樣品DNA提取、PCR擴(kuò)增及測(cè)序
    2.2 數(shù)據(jù)處理
3 結(jié)果
    3.1 序列長(zhǎng)度及種內(nèi)、種間K2P遺傳距離分析
    3.2 NJ樹分析
    3.3 ITS2二級(jí)結(jié)構(gòu)的分析
4 討論



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