免疫受體蛋白Sw-5b誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)的信號(hào)傳導(dǎo)域及其作用機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2024-07-02 21:45
植物進(jìn)化出了細(xì)胞表面的免疫受體蛋白(Pattern recognition receptor,PRR)和胞內(nèi)免疫受體蛋白(Nucleotide-binding leucine-rich repeat receptor,NLR)來(lái)識(shí)別病原效應(yīng)因子并進(jìn)而啟動(dòng)先天免疫系統(tǒng)來(lái)抵御病原物的侵染。NLR類(lèi)受體蛋白作為最大的一類(lèi)抗性蛋白,其結(jié)構(gòu)主要包括N端結(jié)構(gòu)域、核酸結(jié)合結(jié)構(gòu)域(Nucleotide-binding,NB)和富亮氨酸重復(fù)的結(jié)構(gòu)域(Leucine-rich repeat,LRR),根據(jù)其N(xiāo)末端結(jié)構(gòu)域不同大致分為N末端含有Toll-白細(xì)胞介素1受體(Toll/IL-1 receptor,TIR)結(jié)構(gòu)域的TIR-NBS-LRR和N末端含有卷曲螺旋(Coiled-coil,CC)結(jié)構(gòu)域的CC-NBS-LRR兩大類(lèi)型。NLR免疫受體蛋白識(shí)別病原物效應(yīng)因子并迅速激活下游信號(hào)傳導(dǎo)途徑,引發(fā)寄主產(chǎn)生強(qiáng)烈的過(guò)敏性程序化壞死反應(yīng)(Hypersensitive response-programmed cell death,HR-PCD)。雖然目前植物NLR蛋白激活和信號(hào)傳導(dǎo)的分子細(xì)節(jié)尚未完全了解,但是針對(duì)...
【文章頁(yè)數(shù)】:126 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 植物天然免疫概述
1.1 植物天然免疫系統(tǒng)
1.1.1 PAMP觸發(fā)的基礎(chǔ)免疫反應(yīng)(PTI)
1.1.2 效應(yīng)子觸發(fā)的免疫反應(yīng)(ETI)
1.2 植物NLR蛋白對(duì)效應(yīng)因子的識(shí)別與信號(hào)傳遞
1.2.1 植物NLR對(duì)病原物效應(yīng)因子的識(shí)別
1.2.2 植物NLR蛋白的下游信號(hào)傳導(dǎo)
1.3 核苷酸結(jié)合和NLR寡聚化
1.3.1 NLR蛋白的核苷酸結(jié)合
1.3.2 NLR蛋白寡聚化
1.4 輔助NLRs
1.5 植物NLR亞細(xì)胞定位的多樣化
1.6 NLR蛋白介導(dǎo)的下游信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和防御激活
1.6.1 NLR蛋白介導(dǎo)的下游免疫信號(hào)
1.6.2 與效應(yīng)因子觸發(fā)的免疫反應(yīng)(ETI)相關(guān)的細(xì)胞變化
2 長(zhǎng)線形病毒科(Closteroviridae)概述
2.1 長(zhǎng)線形病毒科病毒的生物學(xué)特性
2.2 長(zhǎng)線形病毒家族的基因重組
2.2.1 長(zhǎng)線形病毒屬病毒的基因重組
2.2.2 毛形病毒屬病毒的基因重組
2.3 萵苣褪綠病毒(Lettuce chlorosis virus)
3 本研究的目的意義
第二章 免疫受體蛋白Sw-5b誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)的信號(hào)傳導(dǎo)域及其作用機(jī)制研究
1 實(shí)驗(yàn)材料和方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 毒源
1.1.3 番茄抗病基因Sw-5b
1.1.4 引物
1.1.5 菌株
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 培養(yǎng)基配制
1.2.2 感受態(tài)制備
1.2.3 載體構(gòu)建
1.2.4 質(zhì)粒電轉(zhuǎn)農(nóng)桿菌并浸潤(rùn)寄主植物
1.2.5 Western Blot分析
1.2.6 免疫共沉淀(Co-IP)
1.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)
1.2.8 觀察植物細(xì)胞熒光表達(dá)
1.2.9 氨基酸序列比對(duì)和同源建模
2 結(jié)果與分析
2.1 Sw-5b NB結(jié)構(gòu)域單獨(dú)足以誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)
2.2 NB介導(dǎo)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)依賴(lài)于SGT1
2.3 NB結(jié)構(gòu)域的N端和C端對(duì)誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)都具有重要作用
2.4 P-loop基序?qū)B觸發(fā)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)的作用鑒定
2.5 NB結(jié)構(gòu)域的二聚體化對(duì)于其誘導(dǎo)細(xì)胞死亡是必需的
2.6 NB結(jié)構(gòu)域誘導(dǎo)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)需要NB的細(xì)胞質(zhì)分布
2.7 輔助蛋白NRCs參與NB介導(dǎo)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)過(guò)程
3 討論
第三章 中國(guó)萵苣褪綠病毒南京分離物的全長(zhǎng)基因組測(cè)定和序列分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 毒源
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 Trizol法提取植物RNA
1.2.2 逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)
1.2.3 測(cè)序
1.2.4 RNA 3'Race
1.2.5 RNA 5'Race
1.2.6 序列組裝、ORF預(yù)測(cè)、氨基酸序列比對(duì)和進(jìn)化樹(shù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 LCV-NJ基因組RNA1的全長(zhǎng)序列測(cè)定與分析
2.2 LCV-NJ基因組RNA2的全長(zhǎng)序列測(cè)定與分析
2.3 LCV-NJ的5'UTR和3'UTR分析
2.4 LCV-NJ的系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 討論
第四章 全文總結(jié)
1.1 全文總結(jié)
1.1.1 免疫受體蛋白Sw-5b誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)的信號(hào)傳導(dǎo)域及其作用機(jī)制研究
1.1.2 中國(guó)萵苣褪綠病毒南京分離物的全長(zhǎng)基因組測(cè)定和序列分析
1.2 本研究的創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄A 縮略詞表
附錄B 載體構(gòu)建及引物信息
附錄C 常用抗生素及試劑的配制方法
附錄D 研究生期間學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
致謝
本文編號(hào):4000058
【文章頁(yè)數(shù)】:126 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 植物天然免疫概述
1.1 植物天然免疫系統(tǒng)
1.1.1 PAMP觸發(fā)的基礎(chǔ)免疫反應(yīng)(PTI)
1.1.2 效應(yīng)子觸發(fā)的免疫反應(yīng)(ETI)
1.2 植物NLR蛋白對(duì)效應(yīng)因子的識(shí)別與信號(hào)傳遞
1.2.1 植物NLR對(duì)病原物效應(yīng)因子的識(shí)別
1.2.2 植物NLR蛋白的下游信號(hào)傳導(dǎo)
1.3 核苷酸結(jié)合和NLR寡聚化
1.3.1 NLR蛋白的核苷酸結(jié)合
1.3.2 NLR蛋白寡聚化
1.4 輔助NLRs
1.5 植物NLR亞細(xì)胞定位的多樣化
1.6 NLR蛋白介導(dǎo)的下游信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和防御激活
1.6.1 NLR蛋白介導(dǎo)的下游免疫信號(hào)
1.6.2 與效應(yīng)因子觸發(fā)的免疫反應(yīng)(ETI)相關(guān)的細(xì)胞變化
2 長(zhǎng)線形病毒科(Closteroviridae)概述
2.1 長(zhǎng)線形病毒科病毒的生物學(xué)特性
2.2 長(zhǎng)線形病毒家族的基因重組
2.2.1 長(zhǎng)線形病毒屬病毒的基因重組
2.2.2 毛形病毒屬病毒的基因重組
2.3 萵苣褪綠病毒(Lettuce chlorosis virus)
3 本研究的目的意義
第二章 免疫受體蛋白Sw-5b誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)的信號(hào)傳導(dǎo)域及其作用機(jī)制研究
1 實(shí)驗(yàn)材料和方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 毒源
1.1.3 番茄抗病基因Sw-5b
1.1.4 引物
1.1.5 菌株
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 培養(yǎng)基配制
1.2.2 感受態(tài)制備
1.2.3 載體構(gòu)建
1.2.4 質(zhì)粒電轉(zhuǎn)農(nóng)桿菌并浸潤(rùn)寄主植物
1.2.5 Western Blot分析
1.2.6 免疫共沉淀(Co-IP)
1.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)
1.2.8 觀察植物細(xì)胞熒光表達(dá)
1.2.9 氨基酸序列比對(duì)和同源建模
2 結(jié)果與分析
2.1 Sw-5b NB結(jié)構(gòu)域單獨(dú)足以誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)
2.2 NB介導(dǎo)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)依賴(lài)于SGT1
2.3 NB結(jié)構(gòu)域的N端和C端對(duì)誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)都具有重要作用
2.4 P-loop基序?qū)B觸發(fā)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)的作用鑒定
2.5 NB結(jié)構(gòu)域的二聚體化對(duì)于其誘導(dǎo)細(xì)胞死亡是必需的
2.6 NB結(jié)構(gòu)域誘導(dǎo)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)需要NB的細(xì)胞質(zhì)分布
2.7 輔助蛋白NRCs參與NB介導(dǎo)的過(guò)敏性壞死反應(yīng)過(guò)程
3 討論
第三章 中國(guó)萵苣褪綠病毒南京分離物的全長(zhǎng)基因組測(cè)定和序列分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1.1 植物材料
1.1.2 毒源
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 Trizol法提取植物RNA
1.2.2 逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)
1.2.3 測(cè)序
1.2.4 RNA 3'Race
1.2.5 RNA 5'Race
1.2.6 序列組裝、ORF預(yù)測(cè)、氨基酸序列比對(duì)和進(jìn)化樹(shù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 LCV-NJ基因組RNA1的全長(zhǎng)序列測(cè)定與分析
2.2 LCV-NJ基因組RNA2的全長(zhǎng)序列測(cè)定與分析
2.3 LCV-NJ的5'UTR和3'UTR分析
2.4 LCV-NJ的系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 討論
第四章 全文總結(jié)
1.1 全文總結(jié)
1.1.1 免疫受體蛋白Sw-5b誘導(dǎo)過(guò)敏性壞死反應(yīng)的信號(hào)傳導(dǎo)域及其作用機(jī)制研究
1.1.2 中國(guó)萵苣褪綠病毒南京分離物的全長(zhǎng)基因組測(cè)定和序列分析
1.2 本研究的創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄A 縮略詞表
附錄B 載體構(gòu)建及引物信息
附錄C 常用抗生素及試劑的配制方法
附錄D 研究生期間學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
致謝
本文編號(hào):4000058
本文鏈接:http://www.lk138.cn/shoufeilunwen/nykjbs/4000058.html
最近更新
教材專(zhuān)著