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大豆DNA去甲基化酶GmDMEs的功能解析

發(fā)布時間:2024-07-05 19:19
  表觀遺傳學(xué)是指在基因的DNA序列不發(fā)生改變的情況下,基因的表達(dá)或表型發(fā)生可遺傳改變的現(xiàn)象。甲基化是DNA的一種化學(xué)修飾,是一種相對穩(wěn)定和可遺傳的表觀遺傳標(biāo)記,對許多生物過程至關(guān)重要。在生物體內(nèi)DNA甲基化和去甲基化的動態(tài)平衡控制著基因表達(dá)強(qiáng)度。DME(DEMETER)是DNA去甲基化所需的一種糖基酶,在擬南芥中dme突變體使胚乳中的DNA甲基化升高,并且影響胚乳的發(fā)育。在苜蓿中dme突變后會影響根瘤的發(fā)育。但大豆中DME蛋白的具體功能尚不清楚。因此在本研究中,以大豆為試驗材料,利用CRISPR/Cas9技術(shù)構(gòu)建了 GmDME突變體,并對突變體進(jìn)行甲基化分析和表型觀察,以進(jìn)一步解析DME的功能。本研究主要結(jié)論如下:1、生物信息學(xué)分析顯示,在大豆基因中存在兩個較高相似度的拷貝,GmDMEa(Glyma.20G1 88300)和GmDMEb(Glyma.10G202200),都具有 ENDO3c 結(jié)構(gòu)域和RRMDME結(jié)構(gòu)域。GmDMEa基因CDS區(qū)全長5553bp編碼1850個氨基酸,GmDMEb基因CDS區(qū)全長4290bp編碼1429個氨基酸。DME在植物界是比較保守...

【文章頁數(shù)】:71 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1?ROSl/DME介導(dǎo)的植物主動DNA去甲基化??

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3’-0H基團(tuán)[24,26],而??APE1L蛋白可以加工3'-PUA末端產(chǎn)生V-OH末端[27],所以ZDP和APE1L產(chǎn)生3’-0H??的反應(yīng)是作為兩個獨立的分支共同參與ROS1/DME介導(dǎo)的DNA去甲基化過程的。甲基??化的胞嘧啶被切除以后,未甲基化的胞嘧啶如何填補縫隙這一....


圖1-3改良后CRJSPR7Cas9作用機(jī)制圖(引自ChenWetal.?2017)??1.7研究的目的與意義??

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圖2-1擬南芥、苜蓿、大豆基因結(jié)構(gòu)圖??2.4.1.2大豆DME蛋白的結(jié)構(gòu)預(yù)測和多序比對??

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圖2-2擬南芥、苜蓿、大豆DME蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測??

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本文編號:4001406

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