本試驗(yàn)以優(yōu)質(zhì)晚粳品種秀水09和抗旱秈稻品系IR2061為親本構(gòu)建的高代雙向回交導(dǎo)入系(introgression lines,ILs)群體和重組自交系(recombinant inbred lines,RILs)群體為材料,利用高密度的SNP標(biāo)記對雙向回交導(dǎo)入系的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,同時(shí)挖掘控制水稻外觀品質(zhì)、碾磨品質(zhì)、蒸煮和食用品質(zhì)以及營養(yǎng)品質(zhì)等品質(zhì)相關(guān)性狀的主效QTL,分析品質(zhì)相關(guān)性狀QTL表達(dá)的遺傳背景和環(huán)境互作效應(yīng),鑒定遺傳背景特異性低且具有環(huán)境穩(wěn)定性的QTL,為水稻品質(zhì)分子育種提供條件。與此同時(shí),本試驗(yàn)利用258份材料種質(zhì)資源對水稻品質(zhì)相關(guān)性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(genome-wide association study,GWAS)分析,結(jié)合基于基因的關(guān)聯(lián)分析和單倍型分析,確定重要QTL的候選基因,為后續(xù)進(jìn)一步轉(zhuǎn)基因驗(yàn)證、挖掘水稻品質(zhì)相關(guān)性狀有利等位基因提供便利。主要研究結(jié)果如下:1.雙向?qū)胂等后w遺傳結(jié)構(gòu)分析利用25,206個(gè)SNP標(biāo)記對秀水09背景的高代回交導(dǎo)入系(XS09-ILs)和IR2061背景的高代回交導(dǎo)入系(IR2061-ILs)進(jìn)行遺傳結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)雙向?qū)胂抵?..

【文章頁數(shù)】：100 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖2.155K芯片SNP位點(diǎn)篩選流程

嘉興市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院選育的優(yōu)質(zhì)晚粳品種，IR2061為國以秀水09為母本與IR2061雜交得到雜交種F1，F(xiàn)1同時(shí)與得到兩套BC2F1，再經(jīng)過多代自交至穩(wěn)定，最終獲得23709-ILs）和240份IR2061背景的高代回交導(dǎo)入系（IR2061獲得235....

圖2.2雙向?qū)胂岛椭亟M自交系群體秀水09基因組所占比例的頻率分布圖

院博士學(xué)位論文第二章雙向?qū)胂等后w遺傳導(dǎo)入系供體導(dǎo)入頻率及X2檢驗(yàn)偏分離入系群體大部分恢復(fù)了輪回親本的基因型，其中在237份XS09-ILs中，供體入頻率平均為8.10%，變幅為2.16%～27.71%，而在240份IR2061-ILs中，導(dǎo)入頻率平均為....

圖4.322,488個(gè)SNP標(biāo)記的最小等位基因頻率分布圖

Table4.1DistributionsofSNPmarkersonchromosomes染色體標(biāo)記數(shù)量基因組大小（Mb）標(biāo)記間隔（kb）ChrMarkerNo.Size(Mb)Spacing(kb)Chr12,78343.215.5Chr....

本文編號：3996979