文冠果bZIP轉(zhuǎn)錄因子家族鑒定和非生物脅迫應(yīng)答模式分析
發(fā)布時間:2024-06-14 19:31
文冠果是我國特有的珍稀木本糧油樹種,其環(huán)境適應(yīng)能力極強,具有耐寒、耐旱、耐貧瘠、耐鹽堿等生理特性。由于文冠果基因組信息不完善,其分子機理方面的研究鮮有報道。堿性亮氨酸拉鏈(bZIP)轉(zhuǎn)錄因子家族是真核生物中分布最廣泛且最保守的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,在調(diào)節(jié)植物的生長發(fā)育和響應(yīng)生物及非生物脅迫中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。文冠果全基因組測序的完成為從分子層面揭開文冠果抗逆響應(yīng)機理奠定了基礎(chǔ)。本研究首次在文冠果全基因組數(shù)據(jù)中挖掘bZIP家族基因,并對其進行了系統(tǒng)地分析,得出以下結(jié)論:1、根據(jù)文冠果全基因組測序信息,從文冠果基因組中鑒定得到64個文冠果bZIP家族轉(zhuǎn)錄因子。2、基于XsbZIP與AtbZIP、ZmbZIP和GmbZIP轉(zhuǎn)錄因子家族成員的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系構(gòu)建進化樹,將64個XsbZIP轉(zhuǎn)錄因子家族成員分為11個亞家族(A至I,S和U)。3、根據(jù)bZIP結(jié)構(gòu)域堿性區(qū)和鉸鏈區(qū)內(nèi)含子數(shù)量、位置和相位,將XsbZIP基因分為五種模式(a、b、c、d和e)。4、共鑒定出XsbZIP轉(zhuǎn)錄因子中的20個保守基序,某些保守基序可能賦予了基因特定的功能。5、相比于串聯(lián)重復(fù),片段重復(fù)在文冠果bZIP基因家族的擴增...
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3994324
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圖24A^Z//>基因bZIP結(jié)構(gòu)域堿性區(qū)和鉸鏈區(qū)內(nèi)含子模式??根據(jù)內(nèi)含子數(shù)量、位置和相位,文冠果6Z/P家族基因可被分為五種模式(a、6、c、d和e)
?東北林業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文???堿性區(qū)?鉸鏈區(qū)??內(nèi)含子模式內(nèi)含子數(shù)量?^^——^?XsbZIP蛋白數(shù)目?亞家族??-25?-20?-15?-10?-5?+1??P0??17?九?G,U??|P0?|P0???^??b?D??1?19?C,E,H,I,U??|P2?.??0?16....
圖3非生物脅迫和ABA處理后jMZ//5基因表達模式??(a)文冠果6Z/尸基因表達模式熱圖
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