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滇重樓辣椒輕斑駁病毒分離物的鑒定及全基因組序列分析

發(fā)布時(shí)間:2025-01-04 01:00
   滇重樓(Paris polyphylla var. yunnanensis)是多年生草本植物,其藥用部位為地下根莖,是一種重要的中藥材。為明確侵染滇重樓的病毒病原,對(duì)采自云南省曲靖市的滇重樓進(jìn)行透射電鏡觀察、DASELISA和RT-PCR技術(shù)檢測(cè)。在透射電鏡下觀察到桿狀病毒粒子,大小為(200~300)nm×(20~36)nm。對(duì)采集到的7份病樣進(jìn)行DAS-ELISA檢測(cè),結(jié)果表明,其中5份病樣呈陽(yáng)性。通過RT-PCR技術(shù)擴(kuò)增、克隆獲得1個(gè)全長(zhǎng)為6 357 bp的曲靖分離物PMMoV-QJ的全基因組序列。將PMMoV-QJ的全基因組序列與國(guó)內(nèi)外已經(jīng)報(bào)道的10個(gè)PMMoV分離物進(jìn)行同源性分析比對(duì),其同源性為99.42%~99.81%;谌蛐蛄械南到y(tǒng)發(fā)育分析表明,PMMoV-QJ與韓國(guó)分離物親緣關(guān)系密切。本研究明確了該分離物的親緣關(guān)系,從分子水平鑒定該分離物,為后續(xù)滇重樓病毒病的預(yù)防提供理論依據(jù)。

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【部分圖文】:

圖1 田間滇重樓病葉癥狀

圖1 田間滇重樓病葉癥狀

對(duì)采集到的7份病樣進(jìn)行DAS-ELISA檢測(cè),結(jié)果表明,其中5份病樣呈陽(yáng)性(表2)。圖2滇重樓病葉中提純得到的桿狀病毒粒子


圖2 滇重樓病葉中提純得到的桿狀病毒粒子

圖2 滇重樓病葉中提純得到的桿狀病毒粒子

圖1田間滇重樓病葉癥狀2.4PMMoV-QJRT-PCR擴(kuò)增結(jié)果


圖3 不同來源的PMMo V分離物的全基因組序列系統(tǒng)進(jìn)化樹

圖3 不同來源的PMMo V分離物的全基因組序列系統(tǒng)進(jìn)化樹

將PMMoV-QJ的基因全序列與上述10個(gè)PM-MoV分離物進(jìn)行比對(duì)后,通過MEGA7.0軟件,采用Neighbor-Joining聚類分析方法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖3)。結(jié)果表明,將所有PMMoV分離物聚集在一起,形成兩大支系群體。PMMoV-QJ與中國(guó)葫蘆島分離物PMMoV-Hu....



本文編號(hào):4022656

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