發(fā)布時(shí)間：2024-07-07 05:11

　　病毒是地球上目前所知的最古老、數(shù)量最多、適應(yīng)性最強(qiáng)的生物實(shí)體(biological entities),代表著巨大、多樣的新基因源,病毒進(jìn)化因而很可能也影響到宿主的進(jìn)化。研究病毒進(jìn)化不僅可以了解病毒的多樣性,預(yù)測(cè)和解釋新病毒病的出現(xiàn),而且可以深入認(rèn)識(shí)病毒-宿主間的互作關(guān)系,揭示病毒-宿主之間遺傳信息的交流。病毒基因組比較是研究病毒互作與進(jìn)化的重要方式,但是常常會(huì)受到數(shù)據(jù)的限制,比如可用的病毒基因組數(shù)據(jù)量偏少,或著樣本不具代表性。更重要的是,病毒沒(méi)有化石,病毒進(jìn)化研究只能局限在現(xiàn)存病毒上。由于逆轉(zhuǎn)錄病毒(retroviruses)能夠發(fā)生基因組整合,在數(shù)百萬(wàn)年的進(jìn)化歷程中它們偶爾會(huì)內(nèi)生化(endogenization)到宿主基因組中形成內(nèi)源逆轉(zhuǎn)錄病毒(endogenous retroviruses)。這些內(nèi)源病毒序列實(shí)際上代表著古老病毒基因組的“分子化石”,保留了古代病毒與宿主互作的重要信息,因此對(duì)研究病毒-宿主長(zhǎng)期的互作與進(jìn)化歷史極為寶貴。此前一直認(rèn)為非逆轉(zhuǎn)錄病毒通常并不能夠發(fā)生基因組整合,形成“病毒化石”的例子就更加罕見(jiàn)。 本研究一方面立足于所在實(shí)驗(yàn)室長(zhǎng)期研究的核盤(pán)菌(Sclerot...

【文章頁(yè)數(shù)】：258 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖1.4假定的內(nèi)源病毒因子形成過(guò)程及其與現(xiàn)存病毒的關(guān)系(Johnson，2010)

整合到宿主生殖細(xì)胞的染色體上，形成的前病毒能夠以孟德?tīng)柕姆绞竭z傳給子代仍envenistectal，1974:Jae城seh，1976)，也即病毒DNA同化到宿主基因組中的過(guò)程稱為內(nèi)生化(endogeniZation)(Fesehotte，2010)(圖1.4)，這也是....

圖1.4論文研究技術(shù)路線圖

病毒宿主范圍廣泛性和非逆轉(zhuǎn)錄病毒內(nèi)生化現(xiàn)象，探討病毒內(nèi)生化機(jī)制、起源進(jìn)化以及病毒與宿主在基因組水平_1:的互作與進(jìn)化關(guān)系，揭示病毒在真核生物進(jìn)化中的重要作用(圖1.4)。核盤(pán)菌咧EST數(shù)據(jù)Jl側(cè)戛.鷺憶魚(yú)_遂鷺\/}病毒基因組!\數(shù)據(jù)庫(kù)/\道絲復(fù)旦男~絲到l.P--握遭娜/r內(nèi)源....

圖2.25、RV一l二‘151之NAeDNA克隆策略和推定的基因組結(jié)構(gòu)

圖2.25、RV一l二‘151之NAeDNA克隆策略和推定的基因組結(jié)構(gòu)A，紅_色短線(A一J)表小川隨機(jī)引物克隆到的序列，流色雙向箭頭(1一26)發(fā)小川RT一PCR和RLM一I認(rèn)C克隆到的序列;B，長(zhǎng)萬(wàn)框表小ORF，推定編碼蛋獷l含了J一ss(+)RNA病，!i類甲病毒超到l)J....

圖2.3M一和s一dsRNA推定的基因組結(jié)構(gòu)比較

圖2.3M一和s一dsRNA推定的基因組結(jié)構(gòu)比較長(zhǎng)方框表示ORF，實(shí)線表示非編碼區(qū)，均按比例繪制;亮灰色區(qū)域和點(diǎn)劃線指出S一dsRNA相對(duì)于M一dsRNA缺失的部分�！癟CC”三核有酸重復(fù)所在的位置已標(biāo)出。Fig.2.3SchematierePresentationofPredi....

本文編號(hào)：4003204