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基于UPLC-MS/MS的骨關(guān)節(jié)炎骨贅軟骨的代謝輪廓分析

發(fā)布時間:2020-12-07 14:01
  背景膝關(guān)節(jié)骨性關(guān)節(jié)炎(Osteoarthritis,OA)是常見的退行性關(guān)節(jié)疾病,主要表現(xiàn)為軟骨磨損、軟骨下骨硬化和骨贅增生。研究表明,病理性軟骨內(nèi)成骨是導(dǎo)致軟骨退變最直接的原因,但其形成和作用機制目前仍不清楚。代謝組學(xué)(Metabolomics)是近年發(fā)展起來的新興學(xué)科,可通過檢測生物樣本中的所有小分子代謝物,并進(jìn)行多種統(tǒng)計分析及鑒定,篩選特異性生物標(biāo)志物,探索疾病發(fā)生發(fā)展的規(guī)律。目的利用代謝組學(xué)實驗平臺,結(jié)合多元統(tǒng)計分析軟件平臺,探索骨性關(guān)節(jié)炎骨贅形成的分子機制。方法本研究分別納入實驗組(骨贅組)34例和對照組32例名對象,所有檢測樣本均取自實驗組34名患者的不同部位軟骨組織(骨贅處或股骨后髁處)。依托超高效液相色譜串聯(lián)質(zhì)聯(lián)(UPLC-MS/MS)平臺,應(yīng)用親水相色譜(HILIC)和反相色譜(RPLC)分別對兩組骨贅軟骨組織中代謝譜進(jìn)行分析。輸出原始數(shù)據(jù)通過Markerview軟件進(jìn)行降噪、標(biāo)準(zhǔn)化并導(dǎo)出。利用Simca-P軟件進(jìn)行主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘法判別分析(OPLS-DA),于OPLS鑒定后的最佳模型中導(dǎo)出各代謝物的標(biāo)量投影重要性(VIP)值。利用SPSS軟件對... 

【文章來源】:重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】:43 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于UPLC-MS/MS的骨關(guān)節(jié)炎骨贅軟骨的代謝輪廓分析


組標(biāo)本取樣位置的X線(a,d)、大體標(biāo)本(b,e)和組織學(xué)切片(c,f)

分析結(jié)果圖,樣本,模型,組內(nèi)


圖 2. 對 QC 樣本行 PCA 分析結(jié)果。a 圖 同次樣本,b 圖 分次樣本。所有 QC 樣本均顯出了 好的聚合 勢。Figure 2. (a) PCA analysis was performed including intra-day QC samples of 4 modes. (b) PCanalysis was performed including inter-day QC samples (green) and experimental sample(red). All QC samples clustered tightly.3.3 統(tǒng)計學(xué)分析實驗組和對照組間的差異分別使用 PCA 模型和 OPLS-DA 模型進(jìn)行分析。PCA 模型中兩組組內(nèi)聚集和組間離散均不明顯,因此未能識別出兩組間的差異(圖 3)。OPLS-DA 模型下四種模式組內(nèi)聚集和組間離散均明顯,兩組差異顯著(圖 4)。四個 OPLS-DA 模型的 R2 和 Q2 值均大于 0.5,且七次交互驗證和置換檢驗均證明模型穩(wěn)定可靠。因?qū)嶒灲M骨贅分級不同,進(jìn)一步按其組織學(xué)分級進(jìn)行亞組分析后并無陽性結(jié)果。從驗證后的 OPLS-DA 模型中導(dǎo)出各差異性峰的 VI

PCA模型,樣本,組內(nèi),組間


3. 組樣本的 PCA 模型。模型中未觀察到無明顯組內(nèi)聚集和組間離散。igure 3. Osteophyte group was not separated from control group significantly in all Podels.

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]關(guān)節(jié)內(nèi)注射富血小板血漿對膝關(guān)節(jié)軟骨退行性變的治療作用[J]. 李明,張長青,艾自勝,袁霆,馮勇,賈偉濤.  中國修復(fù)重建外科雜志. 2011(10)



本文編號:2903381

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