發(fā)布時(shí)間：2018-07-14 20:39

【摘要】：基因芯片以其高通量、微型化和自動(dòng)化等優(yōu)點(diǎn)成為醫(yī)學(xué)基因診斷的重要工具,芯片探針的設(shè)計(jì)和篩選是制備高質(zhì)量基因芯片關(guān)鍵步驟之一。目前,已有不少探針設(shè)計(jì)軟件被開(kāi)發(fā)出來(lái),它們針對(duì)不同的設(shè)計(jì)對(duì)象,顯示出各自的優(yōu)勢(shì)和局限性。本文聚焦寡核苷酸探針篩選設(shè)計(jì)的三個(gè)基本標(biāo)準(zhǔn),即特異性、敏感性和熔點(diǎn)(Tm),介紹了探針設(shè)計(jì)軟件研究發(fā)展?fàn)顩r。結(jié)合文獻(xiàn)報(bào)道,對(duì)軟件的用途進(jìn)行分類(lèi)說(shuō)明。本綜述將有助于用戶(hù)快速選擇合適的軟件用于探針設(shè)計(jì),對(duì)降低芯片制備成本、提高芯片應(yīng)用研究效率、促進(jìn)高性能的探針設(shè)計(jì)軟件研究及商品化具有重要的意義。
[Abstract]:Because of its high throughput, miniaturization and automation, gene microarray has become an important tool for medical gene diagnosis. The design and screening of microarray probes is one of the key steps in the preparation of high quality gene chips. At present, many probe design software have been developed, which show their respective advantages and limitations for different design objects. In this paper, we focus on three basic criteria for the screening and design of oligonucleotide probes, namely specificity, sensitivity and melting point (TM), and introduce the development of probe design software. Combined with the literature report, the use of the software is classified and explained. This review will help users to quickly select suitable software for probe design. It is of great significance to reduce the cost of chip preparation, improve the efficiency of chip application research and promote the research and commercialization of high performance probe design software.
【作者單位】： 中南大學(xué)地球科學(xué)與信息物理學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(60801019,61371042) 中南大學(xué)中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專(zhuān)項(xiàng)資金資助(2013zzts252)
【分類(lèi)號(hào)】：R318.6

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2122880