發(fā)布時(shí)間：2024-05-22 21:38

　　該研究以沙冬青和矮沙冬青葉綠體基因組為研究對(duì)象,比較分析其基因組結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。結(jié)果顯示:(1)沙冬青和矮沙冬青的葉綠體基因組具有典型的四段式結(jié)構(gòu),全長(zhǎng)為153 935 bp和154 140 bp,其中大單拷貝區(qū)(LSC)分別為83 891 bp和84 126 bp,小單拷貝區(qū)(SSC)分別為18 022 bp和18 014 bp,以及長(zhǎng)度各自為26 011 bp和26 000 bp的成對(duì)反向重復(fù)區(qū)(IRs);沙冬青和矮沙冬青均注釋130個(gè)基因,包括85個(gè)蛋白編碼基因(PCGs),37個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)以及8個(gè)核糖體RNA(rRNA)。(2)沙冬青和矮沙冬青的葉綠體基因組中分別檢測(cè)出26和15個(gè)回文重復(fù)序列,39和50個(gè)串聯(lián)重復(fù)序列,23和34個(gè)散在重復(fù)序列。同時(shí)都鑒定出96個(gè)SSRs位點(diǎn),包括74和73個(gè)單核苷酸重復(fù),5和6個(gè)二核苷酸重復(fù),以及各有17個(gè)復(fù)合SSR位點(diǎn);邊界分析顯示兩者IR區(qū)相似,但仍有一定差異。(3)通過(guò)近鄰結(jié)合法(NJ)對(duì)沙冬青和矮沙冬青在內(nèi)的17種蝶形花亞科以及2種云實(shí)亞科植物的葉綠體基因組構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,沙冬青和矮沙冬青以較高的支持率聚為一個(gè)獨(dú)...

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【部分圖文】：

圖1沙冬青和矮沙冬青實(shí)驗(yàn)材料

IR區(qū)域在葉綠體基因組中具有高度保守性,但是IR/SC邊界區(qū)域仍存在細(xì)微變化。IR區(qū)邊界的膨脹和收縮是被認(rèn)為被子植物葉綠體基因組大小變化的主要原因。本研究比較分析沙冬青和矮沙冬青和其他4種蝶形花亞科(Papilionoideae)物種海南黃檀(Dalbergiahainanen....

圖2沙冬青和矮沙冬青葉綠體全基因組物理圖譜

IR區(qū)和SC區(qū)邊界的膨脹和收縮被認(rèn)為是被子植物葉綠體全基因組大小變化的主要機(jī)制[33]。在植物進(jìn)化過(guò)程中,IR/SC邊界不同程度的擴(kuò)張和收縮導(dǎo)致了邊界和基因組長(zhǎng)度的多樣性[34]。選取沙冬青和矮沙冬青的4種近緣種(海南黃檀、木藍(lán)、白羽扇豆、檀香紫檀)的葉綠體全基因組作為參考序列,....

圖3沙冬青和矮沙冬青IR區(qū)邊界比較

選取沙冬青和矮沙冬青在內(nèi)的17種蝶形花亞科以及2種云實(shí)亞科植物的葉綠體全基因組進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建,以白花羊蹄甲(Bauhiniaacuminata)和湖北紫荊(Cercisglabra)作為外類群,利用近鄰結(jié)合法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果顯示15個(gè)分枝節(jié)點(diǎn)的bootstrap值都....

圖4基于NJ法19種植物葉綠體全基因組構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

圖3沙冬青和矮沙冬青IR區(qū)邊界比較3討論

本文編號(hào)：3980572