為了提高基因的表達(dá)效率,利用葉綠體基因工程提高美國(guó)紅梣的重要特性,利用Codon W 1.4.2和在線軟件CUSP分析了美國(guó)紅梣葉綠體基因組中的52條基因編碼序列密碼子偏好性。結(jié)果表明,美國(guó)紅梣葉綠體基因組密碼子的GC含量依次為GC₁(45.23%)>GC₂(39.23%)>GC₃(26.19%);有效密碼子數(shù)(ENC)范圍為37.55～55.28,其中ENC值>45的有34個(gè);RSCU>1的密碼子有29個(gè),其中14個(gè)以U結(jié)尾、12個(gè)以A結(jié)尾,表明其偏好以A、U結(jié)尾,且偏倚很弱。中性點(diǎn)圖分析表明,GC₁₂與GC₃的相關(guān)系數(shù)為0.321 7,回歸系數(shù)為-0.538 5,相關(guān)性不顯著;美國(guó)紅梣葉綠體基因組的GC含量是高度保守的,密碼子偏好主要受環(huán)境選擇的影響;17個(gè)密碼子被確定最優(yōu)密碼子。本研究為美國(guó)紅梣葉綠體遺傳工程和遺傳多樣性分析提供了科學(xué)依據(jù)。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 密碼子組成分析
        1.2.2 中性繪圖分析
        1.2.3 最優(yōu)密碼子的確定
2 結(jié)果與分析
    2.1 密碼子堿基組成
    2.2 中性繪圖分析
    2.3 最優(yōu)密碼子確定
3 討論與結(jié)論



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