美國紅梣葉綠體基因組密碼子偏好性分析
發(fā)布時間:2024-05-14 22:19
為了提高基因的表達效率,利用葉綠體基因工程提高美國紅梣的重要特性,利用Codon W 1.4.2和在線軟件CUSP分析了美國紅梣葉綠體基因組中的52條基因編碼序列密碼子偏好性。結(jié)果表明,美國紅梣葉綠體基因組密碼子的GC含量依次為GC1(45.23%)>GC2(39.23%)>GC3(26.19%);有效密碼子數(shù)(ENC)范圍為37.55~55.28,其中ENC值>45的有34個;RSCU>1的密碼子有29個,其中14個以U結(jié)尾、12個以A結(jié)尾,表明其偏好以A、U結(jié)尾,且偏倚很弱。中性點圖分析表明,GC12與GC3的相關(guān)系數(shù)為0.321 7,回歸系數(shù)為-0.538 5,相關(guān)性不顯著;美國紅梣葉綠體基因組的GC含量是高度保守的,密碼子偏好主要受環(huán)境選擇的影響;17個密碼子被確定最優(yōu)密碼子。本研究為美國紅梣葉綠體遺傳工程和遺傳多樣性分析提供了科學依據(jù)。
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 密碼子組成分析
1.2.2 中性繪圖分析
1.2.3 最優(yōu)密碼子的確定
2 結(jié)果與分析
2.1 密碼子堿基組成
2.2 中性繪圖分析
2.3 最優(yōu)密碼子確定
3 討論與結(jié)論
本文編號:3973494
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1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 密碼子組成分析
1.2.2 中性繪圖分析
1.2.3 最優(yōu)密碼子的確定
2 結(jié)果與分析
2.1 密碼子堿基組成
2.2 中性繪圖分析
2.3 最優(yōu)密碼子確定
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