DNA-多肽共聚物的設(shè)計與組裝
【學(xué)位單位】:江南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:TQ317;O641.3
【部分圖文】:
江南大學(xué)碩士學(xué)位論文雙鏈 DNA 具有持久剛性的長度約為 50 nm,而單鏈 DNA 具有了設(shè)計上的柔韌性。這種剛性與柔韌性相結(jié)合的結(jié)構(gòu)特征使其納米材料的構(gòu)建上有著得天獨厚的優(yōu)異性能。另一方面,不論修飾的 DNA,都可以在實驗室中經(jīng)自動化的 DNA 合成儀快速類型的納米結(jié)構(gòu)構(gòu)建途徑:“自上而下”構(gòu)建系統(tǒng)是對少量原子操作的一種模式,而在“自下而上”結(jié)構(gòu)中,許多分子根據(jù)分驟自組裝。作為一種基于化學(xué)的裝配系統(tǒng),DNA 已成為自下者。
著不斷地深入研究,開始出現(xiàn)更多更加快速方便的設(shè)計方法,從而加快米技術(shù)的進步。2006 年 Rothemund 的論文引發(fā)了結(jié)構(gòu) DNA 納米技術(shù)的時開啟了 DNA 折紙結(jié)構(gòu)的時代[10]。Rothemund 的折紙方法是借助一組 寡核苷酸鏈將約 7 千個堿基的單鏈支架 DNA 固定在適當?shù)奈恢,將支所需尺寸(大約 100nm)的二維結(jié)構(gòu)。Rothemund 利用來自 M13mp18 噬狀基因組 DNA 作為支架,設(shè)計和構(gòu)建了星形,笑臉、以及三角形等二維結(jié))。從此,M13mp18 DNA 鏈因具有良好的折疊性能而一直是 DNA 折紙中鏈。目前,越來越多的研究小組正在利用 DNA 分子的序列特異性和優(yōu)異設(shè)計并制造了許多具有多種功能的 DNA 裝置,如鑷子,齒輪,起重機等 DNA 納米結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換為動態(tài)納米結(jié)構(gòu)[11]。DNA 行走裝置是 DNA 納米結(jié)構(gòu)態(tài)裝置。它們具有強大的能力,可以驅(qū)動設(shè)計的模塊在預(yù)設(shè)的軌道上行走圖 1-2 基于固定連接點、粘性末端和 DNA 瓦片的納米結(jié)構(gòu)設(shè)計Fig. 1-2 Nanostructures design based on junctions, sticky ends and DNA tiles:最早使用四條單鏈 DNA 構(gòu)建具有固定分支網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的實例[5];(b):第一個被構(gòu)建(c):DNA 瓦片組建大型二維 DNA 陣列[7];(d):DNA 三重瓦片結(jié)構(gòu)構(gòu)建的 DNA 納
設(shè)計和構(gòu)建了星形,笑臉、以及三角形等二維結(jié)構(gòu)(圖1-3 (a))。從此,M13mp18 DNA 鏈因具有良好的折疊性能而一直是 DNA 折紙中最常用的支架鏈。目前,越來越多的研究小組正在利用 DNA 分子的序列特異性和優(yōu)異的可編程性,設(shè)計并制造了許多具有多種功能的 DNA 裝置,如鑷子,齒輪,起重機等,成功將靜態(tài) DNA 納米結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換為動態(tài)納米結(jié)構(gòu)[11]。DNA 行走裝置是 DNA 納米結(jié)構(gòu)中最復(fù)雜的動態(tài)裝置。它們具有強大的能力,可以驅(qū)動設(shè)計的模塊在預(yù)設(shè)的軌道上行走,行走過程通常需要通過鏈雜交[12-14]、酶促反應(yīng)和環(huán)境刺激的組合來實現(xiàn),通常是通過將化學(xué)能轉(zhuǎn)變?yōu)闄C械能來達到行走的目的。圖 1-3 (b)中是由 Exo III 驅(qū)動在 SNA 表面上移動的DNA 行走裝置的示意圖。目前,越來越多的研究小組正在利用核酸的可編程自組裝特性來創(chuàng)造合理設(shè)計的納米形狀和納米機器,用于許多不同的用途。圖 1-2 基于固定連接點、粘性末端和 DNA 瓦片的納米結(jié)構(gòu)設(shè)計Fig. 1-2 Nanostructures design based on junctions
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