基于2b-RAD技術(shù)的糯玉米品種‘滬玉糯3號(hào)’特異SNP分子標(biāo)記開發(fā)
發(fā)布時(shí)間:2025-01-15 15:28
利用2b-RAD (type IIB endonucleases restriction-site associated DNA)技術(shù)對(duì)糯玉米品種‘滬玉糯3號(hào)’及其親本進(jìn)行簡(jiǎn)化基因組測(cè)序。通過與玉米‘B73’參考基因組序列進(jìn)行比對(duì),在3個(gè)糯玉米樣品的共同測(cè)序標(biāo)簽內(nèi)篩選出20 498個(gè)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)位點(diǎn),并基于RADtyping分型策略對(duì)它們進(jìn)行基因型分型。對(duì)其中20 333個(gè)位于玉米10條染色體上的SNP位點(diǎn)的基因型進(jìn)行分析,開發(fā)出6個(gè)可用于‘滬玉糯3號(hào)’品種特異性鑒定的SNP分子標(biāo)記。
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
本文編號(hào):4027499
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圖1 SNPs在糯玉米樣品中的分布
‘申W22’、‘申W48’和‘滬玉糯3號(hào)’在糯玉米10條染色體上無差異的SNP位點(diǎn)有6220個(gè),差異SNP位點(diǎn)14113個(gè)(圖2-A)。各染色體上樣品間無差異SNP位點(diǎn)占樣品間差異SNP位點(diǎn)數(shù)的比例為31.13%~56.23%,平均比例為44.60%(圖2-B)。此外,‘滬玉....
圖2‘滬玉糯3號(hào)’及其親本的基因型分析
圖1SNPs在糯玉米樣品中的分布2.4‘滬玉糯3號(hào)’的品種特異性鑒定
圖3‘滬玉糯3號(hào)’品種特異性鑒定
經(jīng)重復(fù)性TouchdownPCR擴(kuò)增驗(yàn)證,本研究從19對(duì)AC-PCR引物中篩選出S1-1和S1-2、S2-1和S2-2、S3-1和S3-2、S4-1和S4-2、S5-1和S5-2、S6-1和S6-2共6對(duì)引物對(duì)在‘滬玉糯3號(hào)’及其親本間擴(kuò)增出穩(wěn)定、清晰的差異條帶。這6對(duì)引物不僅....
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