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大豆巢式關(guān)聯(lián)作圖群體QTL定位方法的優(yōu)化并用于開花期與籽粒性狀的遺傳解析

發(fā)布時間:2024-06-30 09:20
  大多數(shù)農(nóng)藝、品質(zhì)性狀是由多基因控制的復雜性狀,并且往往受到環(huán)境互作的高度影響。連鎖定位和關(guān)聯(lián)定位是解析復雜性狀遺傳結(jié)構(gòu)的兩種常用方法,基于雙親本分離群體的連鎖定位方法,只能鑒定兩親本之間的多態(tài)性基因位點,而基于自然群體的關(guān)聯(lián)分析方法,能夠檢測同一位點的多個等位變異。連鎖定位初步確定目標性狀QTL的位置,關(guān)聯(lián)分析可快速對目標基因進行精細定位,關(guān)聯(lián)分析和連鎖定位可以相互補充。巢式關(guān)聯(lián)作圖(Nested Association Mapping,NAM)群體,是由一個共同親本與其他多個親本分別雜交而構(gòu)建的多個重組自交系群體的總和,利用了多親本之間更多的遺傳變異以及群體大小增加,NAM成為解析復雜性狀解剖的很有發(fā)展前景的多親本遺傳設(shè)計。該群體的親本數(shù)目相對有限,其中一個共同親本是固定的,能夠相對較好地區(qū)分群體結(jié)構(gòu),在進行關(guān)聯(lián)分析時,可以考慮群體結(jié)構(gòu)對關(guān)聯(lián)結(jié)果造成的影響。NAM群體成為解析復雜性狀的多親本遺傳設(shè)計之一。本研究構(gòu)建了具有共同親本(M8206)的四個大豆重組自交系群體(LM、ZM、MT和MW),整合為一個 LZTWM 群體,并利用 RAD-seq(Restriction-site as...

【文章頁數(shù)】:163 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1-4本研究技術(shù)路線??Fig.?1-4?The?technology?route?of?this?study??

圖1-4本研究技術(shù)路線??Fig.?1-4?The?technology?route?of?this?study??

型的復合區(qū)間聯(lián)作圖混合線性顯關(guān)聯(lián)分析全基隨關(guān)聯(lián)分析方法??(UM),£?作圖(MC'IMI?法?(.丨丨?方法(MLM-GWAS)?(RTM-GWAS)??1?I?I?I?I??以開花期性狀作為研究對象,鑒定L7TWV1群體的高效QTL定位方法??—?I? ̄ ̄??I?,?,?1?....


圖4-丨LZTWM群體利用SNPLDBs標記RTM-GWAS方法法檢測到的開花期(DTF)位點的曼哈頓圖??(左)與QQ圖(右)??F?

圖4-丨LZTWM群體利用SNPLDBs標記RTM-GWAS方法法檢測到的開花期(DTF)位點的曼哈頓圖??(左)與QQ圖(右)??F?

?第四章巢式關(guān)聯(lián)作圖群體開花期性狀的遺傳解析???第一階段,利用一般線性模型(general?linear?model,GLM)方法,為檢測出更多可能??存在的開花期相關(guān)位點,顯著性閾值設(shè)定為P<〇.〇5,在6,137個SNPLDBs標記中檢測??到4,544個SNPLDBs與開....


圖4-2?LZTWM群體RTM-GWAS方?

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圖7-2?LZTWM群體RTM-GWAS方法法檢測到的蛋白質(zhì)含量QTL等位變異效?

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