結(jié)合BIOLOG碳源篩選研究新疆兩鹽湖可培養(yǎng)嗜鹽菌多樣性
本文關(guān)鍵詞:北極海洋沉積物石油降解菌的篩選及系統(tǒng)發(fā)育分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
《新疆大學(xué)》 2013年
結(jié)合BIOLOG碳源篩選研究新疆兩鹽湖可培養(yǎng)嗜鹽菌多樣性
董秀黃
【摘要】:地球上的鹽堿環(huán)境各式各樣,這類環(huán)境有自然形成的,也有人工形成的。由于此類環(huán)境的特殊性,因此其生命形式主要以嗜鹽菌為主。嗜鹽菌作為一類新型微生物資源,具有極為特殊生理結(jié)構(gòu)、遺傳特性和代謝機制等特征,同時還能夠產(chǎn)生許多具有特殊性質(zhì)的生物活性物質(zhì),因此一直都是人們研究的熱點問題之一。 本文利用BIOLOG技術(shù)篩選出鹽湖土壤樣品微生物易于利用的碳源,再將篩選出的碳源添加進分離培養(yǎng)基中,并結(jié)合可培養(yǎng)方法分離新疆哈密南湖和艾丁湖中的嗜鹽菌。然后利用細菌16S rRNA基因通用引物(27F/1492R)進行PCR擴增、測序及BLAST比對,找出與序列相似性最高的已發(fā)表的菌株。運用Mega4.0軟件采用鄰接法(Neighbor-Joining method)構(gòu)建分離菌株的16S rRNA基因系統(tǒng)發(fā)育樹進行系統(tǒng)發(fā)育分析,初步確定所分離菌株的分類地位,獲得嗜鹽菌的多樣性信息,以期為分離培養(yǎng)基碳源設(shè)計建立一種快速可行的方法。 新疆哈密南湖的研究結(jié)果顯示,BIOLOG方法篩選出5種碳源,分別為海藻糖、蔗糖、檸檬酸、甘油和甘露醇,通過將篩選碳源添加至分離培養(yǎng)基的方法對哈密南湖土壤樣品的嗜鹽菌進行培養(yǎng),共分離得到細菌和放線菌66株。經(jīng)分子生物學(xué)鑒定歸屬為細菌域中3個門7個科14個屬,其中厚壁菌門(Firmicutes)為優(yōu)勢類群(35株,53%),芽孢桿菌屬(Bacillus)和Sediminibacillus屬為優(yōu)勢屬;其次是放線菌門(Actinobacteria()22株,33.3%),擬諾卡氏菌屬(Nocardiopsis)和鏈霉菌屬(Streptomyces)為優(yōu)勢屬;變形菌門(Proteobacteria)(9株,13.7%),全部隸屬于鹽單胞菌屬(Halomonas)。這66個菌株歸類于27個可操作分類單元,其中6株16S rRNA基因序列與最近緣種的同源性在94.24%-96.86%之間,可能為潛在的新種或新屬。 新疆艾丁湖的研究結(jié)果顯示,BIOLOG方法篩選出5種碳源,分別為棉子糖、肌醇、檸檬酸、甘露糖和甘露醇,通過將篩選碳源添加至分離培養(yǎng)基的方法對艾丁湖土壤樣品的嗜鹽菌進行培養(yǎng),共分離得到細菌和放線菌71株。經(jīng)分子生物學(xué)鑒定歸屬為細菌域中3個門,其中厚壁菌門(Firmicutes)為優(yōu)勢類群(35株,49.3%),Sediminibacillus為優(yōu)勢屬;其次是變形菌門(Proteobacteria)(22株,31%),全部隸屬于鹽單胞菌屬(Halomonas);放線菌門(Actinobacteria)(14株,19.7%),擬諾卡氏菌屬(Nocardiopsis)為優(yōu)勢屬。這71個菌株歸類于26個可操作分類單元,其中15株16S rRNA基因序列與最近緣種的同源性在80.76%-96.86%之間,可能為潛在的新種或新屬。 新疆兩鹽湖土壤嗜鹽細菌和放線菌均具有較為豐富的生物多樣性,兩鹽湖都是厚壁菌門(Firmicutes)占優(yōu)勢,并且應(yīng)用BIOLOG碳源篩選方法研究新疆兩鹽湖可培養(yǎng)嗜鹽菌多樣性,得知兩鹽湖可能含有豐富的嗜鹽菌新物種,具有進一步開發(fā)研究價值。
【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:新疆大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:Q938.8
【目錄】:
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8 王強;山東省兩個典型礦區(qū)微生物生態(tài)特性及其環(huán)境指示作用研究[D];山東大學(xué);2010年
9 Sawant;[D];中國海洋大學(xué);2003年
10 李筠;與海水養(yǎng)殖相關(guān)的細菌多樣性的研究及方法評價[D];中國海洋大學(xué);2002年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 蕭伊倫;利用Biolog微生物自動分析系統(tǒng)建立常見皮膚癬菌的鑒定數(shù)據(jù)庫[D];復(fù)旦大學(xué);2010年
2 董秀黃;結(jié)合BIOLOG碳源篩選研究新疆兩鹽湖可培養(yǎng)嗜鹽菌多樣性[D];新疆大學(xué);2013年
3 林亮;芽孢桿菌制劑對蝦池微生物群落以及對蝦腸道菌群的影響[D];暨南大學(xué);2005年
4 蓋麗紅;低負荷下污泥的顆粒化及重金屬對顆粒污泥的影響[D];山東大學(xué);2009年
5 張海涵;林木菌根真菌與土壤微生物相互關(guān)系的研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2008年
6 陳承利;重金屬Cd、Pb、Hg污染對土壤微生物及其活性影響研究[D];浙江大學(xué);2006年
7 劉鵬;制藥廢水處理過程中微生物群落功能多樣性研究[D];吉林大學(xué);2007年
8 陳秋芳;不同森林恢復(fù)方式對土壤微生物多樣性的影響[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年
9 劉婧;混合培養(yǎng)對沼澤紅假單孢細菌生長和產(chǎn)氫的影響及生態(tài)學(xué)研究[D];重慶大學(xué);2008年
10 冷國華;城市污水生物脫氮除磷機理及微生物特征研究[D];青島理工大學(xué);2008年
本文關(guān)鍵詞:北極海洋沉積物石油降解菌的篩選及系統(tǒng)發(fā)育分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
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